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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_000371
当前版本: OH-1004 染色体: Chr01 坐标: 6814509-6817433 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2703 bp · LXL04_000371|LXL04_000371|OH1004|cDNA

ATGGCGAATTTGTGCTTGTTCTTGATATTGATAATTGGGGTTCTTTCATGTTGCCAAAAGCCTGCGAGTTGTCAAGTCATCGATGACGATGATGATCTTTTGACTTTGTTAGCCATTAACAAGGAGCTTAGAGTGCTCGATTGGGGGGAAAACGGACTTAAGAACAGCTCAAATTACTGCATGTGGCCTCACATTACTTGTACCTCCGATCAATCGTCTGTCGAAAAGCTTGTTCTTTCTCATCAAAGTCTACAAGGTAA...

CDS

下载 CDS FASTA

2703 bp · LXL04_000371|LXL04_000371|OH1004|CDS

ATGGCGAATTTGTGCTTGTTCTTGATATTGATAATTGGGGTTCTTTCATGTTGCCAAAAGCCTGCGAGTTGTCAAGTCATCGATGACGATGATGATCTTTTGACTTTGTTAGCCATTAACAAGGAGCTTAGAGTGCTCGATTGGGGGGAAAACGGACTTAAGAACAGCTCAAATTACTGCATGTGGCCTCACATTACTTGTACCTCCGATCAATCGTCTGTCGAAAAGCTTGTTCTTTCTCATCAAAGTCTACAAGGTAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

900 aa · LXL04_000371|LXL04_000371|OH1004|PROTEIN

MANLCLFLILIIGVLSCCQKPASCQVIDDDDDLLTLLAINKELRVLDWGENGLKNSSNYCMWPHITCTSDQSSVEKLVLSHQSLQGNLTLLSQLKSLKWLDLSFNTFHGSIPQSFGNLSELEFLDLSYNKFDGSIPTELGKLKNLKSLNLSNNLLMGSIPNELEGLVKLQDFQIYSNHFNGSIPIWVGNLTNLKVFTAYENELNGKIPETLGSLSELQLLNLHSNYLEGSIPTSVFTSGKLEFLVLTQNKLSGTLPEEIG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_000371
TK1151 IDTkA01G616810
OH-1004 IDLXL04_000371
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_000371
位置Chr01:6814509-6817433 (+)
描述Similar to PXC3: Leucine-rich repeat receptor-like tyrosine-protein kinase PXC3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g41820 富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶，可能参与维管组织发育。 暂无已核实直接文献
At5g63930 可能是富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶 At5g63930。 暂无已核实直接文献
At1g17230 富含亮氨酸重复序列的受体样丝/苏氨酸蛋白激酶 At1g17230。 暂无已核实直接文献
At2g33170 推测的富含亮氨酸重复序列的受体样蛋白激酶At2g33170。 暂无已核实直接文献
At5g48940 与RGI1、RGI3、RGI4和RGI5一起，作为RGF肽（例如 RGF1、GLV5/CLEL1/RGF2、GLV7/CLEL3/RGF3、GLV3/RGF4、GLV10/CLEL7/RGF5 和 RGF10/CLELN）的受体，这些肽激素通过调控转录因子PLETHORA（PLT，例如PLT1和PLT2）的表达水平和模式，维持胚后根干细胞利基。
RGF1 INSENSITIVE 1 to 5, a group of LRR receptor-like kinases, are essential for the perception of root meristem growth factor 1 in Arabidopsis thaliana.2016 · DOI: 10.1038/cr.2016.63

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000371 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0004714 transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G17230
ath:AT2G41820
ath:AT5G63930
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.870
排名 1 · LXL04_000371 · OH-1004
内质网0.087
排名 2 · LXL04_000371 · OH-1004
细胞质0.060
排名 3 · LXL04_000371 · OH-1004
细胞核0.038
排名 4 · LXL04_000371 · OH-1004
溶酶体／液泡0.028
排名 5 · LXL04_000371 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13855.13LRR_873-131 aa
PF23598.2LRR_1483-198 aa
PF12799.14LRR_4120-155 aa
PF13855.13LRR_8141-179 aa
PF23598.2LRR_14187-269 aa
PF13855.13LRR_8295-347 aa
PF13855.13LRR_8335-395 aa
PF00069.32Pkinase620-829 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_000371PF13855.13LRR_8731313.5e-2794.6
LXL04_000371PF23598.2LRR_14831981.7e-2487.0
LXL04_000371PF12799.14LRR_41201555.6e-2071.6
LXL04_000371PF13855.13LRR_81411793.5e-2794.6
LXL04_000371PF23598.2LRR_141872691.7e-2487.0
LXL04_000371PF13855.13LRR_82953473.5e-2794.6
LXL04_000371PF13855.13LRR_83353953.5e-2794.6
LXL04_000371PF00069.32Pkinase6208294.5e-2486.0
LXL04_000371PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr6218931.3e-2694.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O22938拟南芥Leucine-rich repeat receptor-like tyrosine-protein kinase PXC367.925%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9LVP0拟南芥Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g6393037.292%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9SHI2拟南芥Leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g1723036.943%Swiss-Prot中等数据库同源证据
O49318拟南芥Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At2g3317036.600%Swiss-Prot中等数据库同源证据
C0LGV1拟南芥LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase RGI235.844%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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