基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA07G021030 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr07:5705174-5713201 (+) |
| 描述 | Similar to PCMP-H82: Pentatricopeptide repeat-containing protein At3g62890 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_006317 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 6 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g01060 |
Myb家族转录因子PHL7。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: A2XYN9 |
转录因子结合靶基因启动子上的特定 DNA 序列,例如 R1BS 基序 5'-NAKATNCN-3' 和 P1BS 基序 5'-GNATATNC-3' 以触发其表达(通过相似性)。 | 暂无已核实直接文献 |
Os04g0665600 |
转录因子,可结合目标基因启动子的特定DNA序列,如R1BS基序5'-NAKATNCN-3'和P1BS基序5'-GNATATNC-3'以触发其表达。 | |
UniProt: A2X0Q0 |
参与磷缺乏信号传导的转录因子。 | 暂无已核实直接文献 |
Os02g0139000 |
参与磷缺乏信号传导的转录因子。 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009451 | RNA modification | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.067; 覆盖度=96.739; E 值=5.69e-15; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0080156 | mitochondrial mRNA modification | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=39.604; 覆盖度=109.783; E 值=2.85e-13; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.067; 覆盖度=96.739; E 值=5.69e-15; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=38.889; 覆盖度=97.826; E 值=1.98e-12; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.067; 覆盖度=96.739; E 值=5.69e-15; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.067; 覆盖度=96.739; E 值=5.69e-15; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G05750 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=38.889; 覆盖度=97.826; E 值=1.98e-12 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G31430 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=57.143; 覆盖度=53.261; E 值=3.33e-12 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G05240 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=39.604; 覆盖度=109.783; E 值=2.85e-13 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G62890 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.067; 覆盖度=96.739; E 值=5.69e-15 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |