基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA03G103320 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr03:26404868-26405542 (-) |
| 描述 | Similar to At5g37930: E3 ubiquitin-protein ligase SINA-like 10 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_007013 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 6 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g37930 |
E3泛素蛋白连接酶,介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g66620 |
E3泛素蛋白连接酶,介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g37870 |
E3泛素蛋白连接酶,介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g37890 |
E3泛素蛋白连接酶,介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g66630 |
E3泛素蛋白连接酶,介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009411 | response to UV | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=34.836; 覆盖度=32.404; E 值=4.17e-44; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016567 | protein ubiquitination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.245; 覆盖度=50.332; E 值=1.39e-55; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathway | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.245; 覆盖度=50.332; E 值=1.39e-55; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=33.871; 覆盖度=32.935; E 值=1.87e-43; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.245; 覆盖度=50.332; E 值=1.39e-55; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0061630 | ubiquitin protein ligase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.245; 覆盖度=50.332; E 值=1.39e-55; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G66620 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=33.333; 覆盖度=32.669; E 值=2.42e-40 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G37870 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=33.871; 覆盖度=32.935; E 值=1.87e-43 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G37890 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=34.836; 覆盖度=32.404; E 值=4.17e-44 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G37910 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=35.965; 覆盖度=30.279; E 值=2.05e-42 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G37930 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.245; 覆盖度=50.332; E 值=1.39e-55 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |