基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_038937 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr09:53661137-53665269 (-) |
| 描述 | Similar to Dnmt3a: DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A (Rattus norvegicus OX%3D10116) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_038937 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g27650 |
与PDP2、PDP3和PDP6一起,与MSI4/FVE和MSI5相互作用,通过调节PRC2复合物的功能和调控H3K27me3水平抑制FLC、MAF4和MAF5的表达,从而促进开花。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g05430 |
可能通过调节 PRC2 复合物的功能和调控 H3K27me3 水平来影响基因表达。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g02950 |
可能通过调节 PRC2 复合物的功能和调控 H3K27me3 水平来影响基因表达。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g09670 |
与 PDP1、PDP3 和 PDP6 一起,通过调节 PRC2 复合物的功能和调控 H3K27me3 水平,与 MSI4/FVE 和 MSI5 相互作用,以抑制 FLC、MAF4 和 MAF5 的表达,从而促进开花。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g40340 |
与 PDP1、PDP2 和 PDP6 一起,与 MSI4/FVE 和 MSI5 相互作用,通过调节 PRC2 复合体功能和调控 H3K27me3 水平抑制 FLC、MAF4 和 MAF5 的表达,从而促进开花。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.985; 覆盖度=97.913; E 值=1.14e-163; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006355 | regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.985; 覆盖度=97.913; E 值=1.14e-163; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009908 | flower development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.985; 覆盖度=97.913; E 值=1.14e-163; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0040029 | epigenetic regulation of gene expression | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.985; 覆盖度=97.913; E 值=1.14e-163; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:2000028 | regulation of photoperiodism, flowering | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.985; 覆盖度=97.913; E 值=1.14e-163; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.985; 覆盖度=97.913; E 值=1.14e-163; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0035098 | ESC/E(Z) complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.985; 覆盖度=97.913; E 值=1.14e-163; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G05430 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=41.538; 覆盖度=45.229; E 值=6.22e-88 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G02950 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=30.612; 覆盖度=24.354; E 值=1.42e-30 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G27650 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.985; 覆盖度=97.913; E 值=1.14e-163 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |