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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDLXL04_038937
当前查询版本OH1004
位置Chr09:53661137-53665269 (-)
描述Similar to Dnmt3a: DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A (Rattus norvegicus OX%3D10116)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_038937 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g27650 与PDP2、PDP3和PDP6一起,与MSI4/FVE和MSI5相互作用,通过调节PRC2复合物的功能和调控H3K27me3水平抑制FLC、MAF4和MAF5的表达,从而促进开花。 暂无已核实直接文献
At3g05430 可能通过调节 PRC2 复合物的功能和调控 H3K27me3 水平来影响基因表达。 暂无已核实直接文献
At5g02950 可能通过调节 PRC2 复合物的功能和调控 H3K27me3 水平来影响基因表达。 暂无已核实直接文献
At3g09670 与 PDP1、PDP3 和 PDP6 一起,通过调节 PRC2 复合物的功能和调控 H3K27me3 水平,与 MSI4/FVE 和 MSI5 相互作用,以抑制 FLC、MAF4 和 MAF5 的表达,从而促进开花。 暂无已核实直接文献
At5g40340 与 PDP1、PDP2 和 PDP6 一起,与 MSI4/FVE 和 MSI5 相互作用,通过调节 PRC2 复合体功能和调控 H3K27me3 水平抑制 FLC、MAF4 和 MAF5 的表达,从而促进开花。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0006351DNA-templated transcription生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.985; 覆盖度=97.913; E 值=1.14e-163; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0006355regulation of DNA-templated transcription生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.985; 覆盖度=97.913; E 值=1.14e-163; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009908flower development生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.985; 覆盖度=97.913; E 值=1.14e-163; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0040029epigenetic regulation of gene expression生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.985; 覆盖度=97.913; E 值=1.14e-163; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:2000028regulation of photoperiodism, flowering生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.985; 覆盖度=97.913; E 值=1.14e-163; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005634nucleus细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.985; 覆盖度=97.913; E 值=1.14e-163; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0035098ESC/E(Z) complex细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.985; 覆盖度=97.913; E 值=1.14e-163; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G05430KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=41.538; 覆盖度=45.229; E 值=6.22e-88UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G02950KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=30.612; 覆盖度=24.354; E 值=1.42e-30UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G27650KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.985; 覆盖度=97.913; E 值=1.14e-163UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release