基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_034971 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr08:8057166-8058794 (+) |
| 描述 | Similar to IQD1: Protein IQ-DOMAIN 1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_034971 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 15 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g03040 |
可能参与与钙调蛋白或类钙调蛋白的协同作用(通过相似性推测)。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g09710 |
可能参与与钙调蛋白或钙调蛋白样蛋白的协同相互作用。 | |
At3g52290 |
可能参与与钙调蛋白或类钙调蛋白的协同作用(通过相似性推测)。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g26410 |
可能参与与钙调蛋白或类钙调蛋白的协同作用(通过相似性推测)。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g59690 |
可能参与与钙调蛋白或类钙调蛋白的协同作用(通过相似性推测)。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006952 | defense response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=34.884; 覆盖度=54.43; E 值=2.45e-22; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009834 | plant-type secondary cell wall biogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=35.556; 覆盖度=42.722; E 值=3.26e-13; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010089 | xylem development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=35.556; 覆盖度=42.722; E 值=3.26e-13; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019761 | glucosinolate biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=34.884; 覆盖度=54.43; E 值=2.45e-22; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051592 | response to calcium ion | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=35.556; 覆盖度=42.722; E 值=3.26e-13; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:2000652 | regulation of secondary cell wall biogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=35.556; 覆盖度=42.722; E 值=3.26e-13; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=34.884; 覆盖度=54.43; E 值=2.45e-22; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=32.296; 覆盖度=81.329; E 值=1.68e-23; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005730 | nucleolus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=34.884; 覆盖度=54.43; E 值=2.45e-22; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005856 | cytoskeleton | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=32.296; 覆盖度=81.329; E 值=1.68e-23; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005874 | microtubule | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=34.884; 覆盖度=54.43; E 值=2.45e-22; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=32.296; 覆盖度=81.329; E 值=1.68e-23; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0055028 | cortical microtubule | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=35.556; 覆盖度=42.722; E 值=3.26e-13; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005516 | calmodulin binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=32.296; 覆盖度=81.329; E 值=1.68e-23; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008017 | microtubule binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=34.884; 覆盖度=54.43; E 值=2.45e-22; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G26410 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.386; 覆盖度=55.696; E 值=3.67e-16 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G09710 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=34.884; 覆盖度=54.43; E 值=2.45e-22 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G52290 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=36.774; 覆盖度=49.051; E 值=1.71e-19 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G59690 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=35.556; 覆盖度=42.722; E 值=3.26e-13 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G03040 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=32.296; 覆盖度=81.329; E 值=1.68e-23 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |