基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_031311 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr07:4428841-4431457 (-) |
| 描述 | Similar to At1g43900: Probable protein phosphatase 2C 11 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_031311 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g43900 |
可能的蛋白质磷酸酶 2C 11。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g24940 |
可能的蛋白磷酸酶 2C 71。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g31750 |
蛋白磷酸酶,调节对病原菌的防御反应,赋予抵抗力并促进水杨酸 积累。 | |
At5g10740 |
可能的蛋白质磷酸酶 2C 69。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os02g0149800 |
可能的蛋白磷酸酶2C 10。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006470 | protein dephosphorylation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=62.738; 覆盖度=77.811; E 值=2.24e-121; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042742 | defense response to bacterium | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=62.738; 覆盖度=77.811; E 值=2.24e-121; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1902531 | regulation of intracellular signal transduction | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.182; 覆盖度=81.361; E 值=3.68e-150; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=64.259; 覆盖度=77.811; E 值=5.44e-122; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=62.738; 覆盖度=77.811; E 值=2.24e-121; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.182; 覆盖度=81.361; E 值=3.68e-150; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009536 | plastid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=64.259; 覆盖度=77.811; E 值=5.44e-122; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016020 | membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.182; 覆盖度=81.361; E 值=3.68e-150; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004722 | protein serine/threonine phosphatase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.182; 覆盖度=81.361; E 值=3.68e-150; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.182; 覆盖度=81.361; E 值=3.68e-150; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G43900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.182; 覆盖度=81.361; E 值=3.68e-150 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G31750 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=62.738; 覆盖度=77.811; E 值=2.24e-121 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G10740 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=63.878; 覆盖度=77.811; E 值=8.92e-121 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G24940 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=64.259; 覆盖度=77.811; E 值=5.44e-122 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0149800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=63.498; 覆盖度=77.811; E 值=3.44e-121 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |