基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_025491 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr05:112496853-112503533 (+) |
| 描述 | Similar to At1g73710: Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g73710 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_025491 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g73710 |
含有五肽重复序列的蛋白 At1g73710。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g23020 |
含五聚肽重复的蛋白 At3g23020。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g61250 |
可能参与膜运输。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: A2YMP7 |
可能参与膜运输。 | 暂无已核实直接文献 |
Os07g0564600 |
可能参与膜运输。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006355 | regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=37.143; 覆盖度=60.203; E 值=3.5e-165; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010343 | singlet oxygen-mediated programmed cell death | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=37.143; 覆盖度=60.203; E 值=3.5e-165; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015031 | protein transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=60.385; 覆盖度=20.328; E 值=3.58e-106; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1904821 | chloroplast disassembly | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=37.143; 覆盖度=60.203; E 值=3.5e-165; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.811; 覆盖度=74.042; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005769 | early endosome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=60.385; 覆盖度=20.328; E 值=3.58e-106; UniProt GO evidence=IEA:EnsemblPlants | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=60.385; 覆盖度=20.328; E 值=3.58e-106; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=37.143; 覆盖度=60.203; E 值=3.5e-165; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030658 | transport vesicle membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=60.385; 覆盖度=20.328; E 值=3.58e-106; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0032588 | trans-Golgi network membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=60.385; 覆盖度=20.328; E 值=3.58e-106; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0055038 | recycling endosome membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=60.385; 覆盖度=20.328; E 值=3.58e-106; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003729 | mRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=37.143; 覆盖度=60.203; E 值=3.5e-165; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G73710 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.811; 覆盖度=74.042; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G23020 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=37.143; 覆盖度=60.203; E 值=3.5e-165 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os07g0564600 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=60.385; 覆盖度=20.328; E 值=4.39e-106 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |