基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_022738 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr05:7235704-7239508 (-) |
| 描述 | Similar to NIK2: Protein NSP-INTERACTING KINASE 2 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_022738 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 16 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g25560 |
受体激酶,与其他CIK(如CIK1、CIK2、CIK3、CIK5和CIK6)冗余作用,作为CLV1、CLV2/CRN和RPK2的共受体,并且需要通过磷酸化介导CLAVATA家族肽(如CLV3、CLE25、CLE26和CLE45)信号;该信号调控原韧皮部分化及维持茎尖分生组织(SAM)和根尖分生组织(RAM)的稳态,并作用于BRX和OPS下游。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g07280 |
具有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性的受体,决定雄性孢原细胞起始细胞的正确数量,并进一步决定绒毡层和中间层细胞的特性。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g63930 |
可能是富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶 At5g63930。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g56100 |
能磷酸化 AGL24。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os02g0283800 |
可能通过油菜素甾醇(BR)信号通路参与调控植物生长。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006952 | defense response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=28.186; 覆盖度=88.579; E 值=1.85e-69; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0007165 | signal transduction | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=28.186; 覆盖度=88.579; E 值=1.85e-69; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009556 | microsporogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=29.335; 覆盖度=81.939; E 值=1.91e-65; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010234 | anther wall tapetum cell fate specification | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=29.335; 覆盖度=81.939; E 值=1.91e-65; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0035556 | intracellular signal transduction | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=28.186; 覆盖度=88.579; E 值=1.85e-69; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046777 | protein autophosphorylation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=29.335; 覆盖度=81.939; E 值=1.91e-65; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048638 | regulation of developmental growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=28.186; 覆盖度=88.579; E 值=1.85e-69; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1901653 | cellular response to peptide | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=28.186; 覆盖度=88.579; E 值=1.85e-69; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=28.186; 覆盖度=88.579; E 值=1.85e-69; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=27.84; 覆盖度=83.001; E 值=1.39e-65; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016020 | membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=29.335; 覆盖度=81.939; E 值=1.91e-65; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004674 | protein serine/threonine kinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=27.84; 覆盖度=83.001; E 值=1.39e-65; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004675 | transmembrane receptor protein serine/threonine kinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=28.186; 覆盖度=88.579; E 值=1.85e-69; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005524 | ATP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=28.186; 覆盖度=88.579; E 值=1.85e-69; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019199 | transmembrane receptor protein kinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=29.335; 覆盖度=81.939; E 值=1.91e-65; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0106310 | protein serine kinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=28.186; 覆盖度=88.579; E 值=1.85e-69; UniProt GO evidence=IEA:RHEA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G25560 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=28.186; 覆盖度=88.579; E 值=1.85e-69 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G56100 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=27.84; 覆盖度=83.001; E 值=1.39e-65 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G07280 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=29.335; 覆盖度=81.939; E 值=1.91e-65 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |