本页使用教程

基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

下载当前结果

基因 IDLXL04_020685
当前查询版本OH1004
位置Chr04:104894729-104896195 (-)
描述Similar to At3g04130: Pentatricopeptide repeat-containing protein At3g04130%2C mitochondrial (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_020685 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g04130 含有五三肽重复的蛋白 At3g04130,线粒体。 暂无已核实直接文献
At3g22670 含五节重复序列蛋白At3g22670,线粒体。 暂无已核实直接文献
At1g74900 线粒体nad1转录本第1个内含子反式剪接所必需;该转录本编码线粒体膜呼吸链NADH脱氢酶(复合体Ⅰ)的ND1亚基。
At5g43820 推测含五聚重复序列蛋白 At5g43820。 暂无已核实直接文献
At1g20300 含五肽重复的蛋白 At1g20300,线粒体。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0006397mRNA processing生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.607; 覆盖度=82.377; E 值=3.71e-47; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0008380RNA splicing生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.607; 覆盖度=82.377; E 值=3.71e-47; UniProt GO evidence=IGI:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005737cytoplasm细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.607; 覆盖度=82.377; E 值=3.71e-47; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005739mitochondrion细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.316; 覆盖度=93.443; E 值=2.72e-168; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCellUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009507chloroplast细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.316; 覆盖度=93.443; E 值=2.72e-168; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003723RNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=37.857; 覆盖度=86.066; E 值=2.79e-93; UniProt GO evidence=IPI:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003729mRNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.316; 覆盖度=93.443; E 值=2.72e-168; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G74900KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.607; 覆盖度=82.377; E 值=3.71e-47UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G04130KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.316; 覆盖度=93.443; E 值=2.72e-168UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G22670KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=37.857; 覆盖度=86.066; E 值=2.79e-93UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G43820KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=27.387; 覆盖度=81.557; E 值=3.58e-42UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release