基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_018896 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:19798110-19799763 (-) |
| 描述 | Similar to U1A: U1 small nuclear ribonucleoprotein A (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_018896 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 15 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g47580 |
参与核前mRNA剪接（通过相似性推测）。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g30260 |
参与细胞核预mRNA剪接。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g06960 |
参与细胞核预mRNA剪接。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os05g0154800 |
参与细胞核预mRNA剪接。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: A2Y0J7 |
参与细胞核预mRNA剪接。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000354 | cis assembly of pre-catalytic spliceosome | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=53.333; 覆盖度=98.361; E 值=6.35e-89; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000398 | mRNA splicing, via spliceosome | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.074; 覆盖度=99.18; E 值=1.43e-118; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006397 | mRNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=69.88; 覆盖度=102.049; E 值=3.15e-116; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008380 | RNA splicing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=69.88; 覆盖度=102.049; E 值=3.15e-116; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009631 | cold acclimation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=50.628; 覆盖度=97.951; E 值=2.4e-82; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.074; 覆盖度=99.18; E 值=1.43e-118; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005654 | nucleoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=53.333; 覆盖度=98.361; E 值=6.35e-89; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005681 | spliceosomal complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.074; 覆盖度=99.18; E 值=1.43e-118; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005685 | U1 snRNP | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.074; 覆盖度=99.18; E 值=1.43e-118; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005686 | U2 snRNP | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=53.333; 覆盖度=98.361; E 值=6.35e-89; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005730 | nucleolus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.074; 覆盖度=99.18; E 值=1.43e-118; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=53.333; 覆盖度=98.361; E 值=6.35e-89; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015030 | Cajal body | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=53.333; 覆盖度=98.361; E 值=6.35e-89; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=69.88; 覆盖度=102.049; E 值=3.15e-116; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030619 | U1 snRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.074; 覆盖度=99.18; E 值=1.43e-118; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G06960 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=50.628; 覆盖度=97.951; E 值=2.4e-82 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G30260 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=53.333; 覆盖度=98.361; E 值=6.35e-89 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G47580 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.074; 覆盖度=99.18; E 值=1.43e-118 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os05g0154800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=69.88; 覆盖度=102.049; E 值=3.15e-116 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |