基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_018444 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:13041174-13043192 (+) |
| 描述 | Similar to CTU2: Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_018444 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g35910 |
在 tRNA 的摇摆位点(tRNA(Lys)、tRNA(Glu) 和 tRNA(Gln))的 mcm(5)S(2)U 的 2-硫化中起核心作用。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: A2ZM73 |
在 tRNA 的摇摆位点(tRNA(Lys)、tRNA(Glu) 和 tRNA(Gln))的 mcm(5)S(2)U 的 2-硫化中起核心作用。 | 暂无已核实直接文献 |
Os12g0588900 |
在 tRNA 的摇摆位点(tRNA(Lys)、tRNA(Glu) 和 tRNA(Gln))的 mcm(5)S(2)U 的 2-硫化中起核心作用。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0002098 | tRNA wobble uridine modification | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=23.866; 覆盖度=109.978; E 值=2.53e-21; UniProt GO evidence=NAS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0002143 | tRNA wobble position uridine thiolation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.113; 覆盖度=102.169; E 值=1.63e-177; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010311 | lateral root formation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.113; 覆盖度=102.169; E 值=1.63e-177; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0032447 | protein urmylation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.113; 覆盖度=102.169; E 值=1.63e-177; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0034227 | tRNA thio-modification | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.113; 覆盖度=102.169; E 值=1.63e-177; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.113; 覆盖度=102.169; E 值=1.63e-177; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.113; 覆盖度=102.169; E 值=1.63e-177; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0032991 | protein-containing complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=23.866; 覆盖度=109.978; E 值=2.53e-21; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000049 | tRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.113; 覆盖度=102.169; E 值=1.63e-177; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016779 | nucleotidyltransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.113; 覆盖度=102.169; E 值=1.63e-177; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016783 | sulfurtransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.113; 覆盖度=102.169; E 值=1.63e-177; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G35910 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.113; 覆盖度=102.169; E 值=1.63e-177 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os12g0588900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=48.02; 覆盖度=87.636; E 值=2.76e-124 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dre:445166 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=24.194; 覆盖度=80.694; E 值=6.17e-17 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | hsa:348180 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=23.866; 覆盖度=109.978; E 值=2.53e-21 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |