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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDLXL04_018444
当前查询版本OH1004
位置Chr04:13041174-13043192 (+)
描述Similar to CTU2: Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_018444 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g35910 在 tRNA 的摇摆位点(tRNA(Lys)、tRNA(Glu) 和 tRNA(Gln))的 mcm(5)S(2)U 的 2-硫化中起核心作用。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2ZM73 在 tRNA 的摇摆位点(tRNA(Lys)、tRNA(Glu) 和 tRNA(Gln))的 mcm(5)S(2)U 的 2-硫化中起核心作用。 暂无已核实直接文献
Os12g0588900 在 tRNA 的摇摆位点(tRNA(Lys)、tRNA(Glu) 和 tRNA(Gln))的 mcm(5)S(2)U 的 2-硫化中起核心作用。 暂无已核实直接文献

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0002098tRNA wobble uridine modification生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=23.866; 覆盖度=109.978; E 值=2.53e-21; UniProt GO evidence=NAS:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0002143tRNA wobble position uridine thiolation生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.113; 覆盖度=102.169; E 值=1.63e-177; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0010311lateral root formation生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.113; 覆盖度=102.169; E 值=1.63e-177; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0032447protein urmylation生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.113; 覆盖度=102.169; E 值=1.63e-177; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRuleUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0034227tRNA thio-modification生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.113; 覆盖度=102.169; E 值=1.63e-177; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005634nucleus细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.113; 覆盖度=102.169; E 值=1.63e-177; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005829cytosol细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.113; 覆盖度=102.169; E 值=1.63e-177; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0032991protein-containing complex细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=23.866; 覆盖度=109.978; E 值=2.53e-21; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0000049tRNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.113; 覆盖度=102.169; E 值=1.63e-177; UniProt GO evidence=IEA:InterProUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016779nucleotidyltransferase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.113; 覆盖度=102.169; E 值=1.63e-177; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRuleUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016783sulfurtransferase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.113; 覆盖度=102.169; E 值=1.63e-177; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT4G35910KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.113; 覆盖度=102.169; E 值=1.63e-177UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGdosa:Os12g0588900KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=48.02; 覆盖度=87.636; E 值=2.76e-124UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGdre:445166KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=24.194; 覆盖度=80.694; E 值=6.17e-17UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGhsa:348180KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=23.866; 覆盖度=109.978; E 值=2.53e-21UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release