基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_017584 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:154360570-154362512 (+) |
| 描述 | Similar to At1g04990: Zinc finger CCCH domain-containing protein 3 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_017584 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g04990 |
体外具有 RNA 结合和核糖核酸酶活性。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g32930 |
含锌指 CCCH 结构域蛋白 26。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g02830 |
含锌指CCCH结构域蛋白33。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os01g0917400 |
含锌指 CCCH 结构域的蛋白 12。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006970 | response to osmotic stress | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.373; 覆盖度=105.063; E 值=9.28e-103; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0017148 | negative regulation of translation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=41.351; 覆盖度=93.671; E 值=4.13e-91; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.373; 覆盖度=105.063; E 值=9.28e-103; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.373; 覆盖度=105.063; E 值=9.28e-103; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=41.351; 覆盖度=93.671; E 值=4.13e-91; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.373; 覆盖度=105.063; E 值=9.28e-103; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003729 | mRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.373; 覆盖度=105.063; E 值=9.28e-103; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004518 | nuclease activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.373; 覆盖度=105.063; E 值=9.28e-103; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.373; 覆盖度=105.063; E 值=9.28e-103; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010313 | phytochrome binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=41.351; 覆盖度=93.671; E 值=4.13e-91; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016787 | hydrolase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.373; 覆盖度=105.063; E 值=9.28e-103; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048027 | mRNA 5'-UTR binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=41.351; 覆盖度=93.671; E 值=4.13e-91; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G04990 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.373; 覆盖度=105.063; E 值=9.28e-103 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G32930 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=44.554; 覆盖度=102.278; E 值=5.74e-93 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G02830 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=41.351; 覆盖度=93.671; E 值=4.13e-91 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |