RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

示例 TkA01G624900 LXL04_000258 文献示例 LXL04_039733 TkAUNG001940

查询结果

下载当前结果

基因 IDLXL04_015086
当前查询版本OH1004
位置Chr03:63209219-63210247 (-)
描述Similar to CIP8: E3 ubiquitin-protein ligase CIP8 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015086 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g64920 E3 泛素蛋白连接酶，介导靶蛋白的泛素化和随后的蛋白酶体降解。
The RING finger motif of photomorphogenic repressor COP1 specifically interacts with the RING-H2 motif of a novel Arabidopsis protein.1999 · DOI: 10.1074/jbc.274.39.27674
Biochemical evidence for ubiquitin ligase activity of the Arabidopsis COP1 interacting protein 8 (CIP8).2002 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2002.01298.x
At3g19950 E3 泛素蛋白连接酶以硫酯的形式接受来自 E2 泛素结合酶的泛素，然后将泛素直接转移至目标底物。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0488800 在体外具有E3泛素-蛋白连接酶活性。
Molecular dissection of Oryza sativa salt-induced RING Finger Protein 1 (OsSIRP1): possible involvement in the sensitivity response to salinity stress.2016 · DOI: 10.1111/ppl.12459

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0006511ubiquitin-dependent protein catabolic process生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.866; 覆盖度=49.216; E 值=2.71e-42; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016567protein ubiquitination生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.866; 覆盖度=49.216; E 值=2.71e-42; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0090378seed trichome elongation生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=46.847; 覆盖度=34.796; E 值=1.45e-24; UniProt GO evidence=IEP:AgBaseUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005634nucleus细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.866; 覆盖度=49.216; E 值=2.71e-42; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005737cytoplasm细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.866; 覆盖度=49.216; E 值=2.71e-42; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0004842ubiquitin-protein transferase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=46.847; 覆盖度=34.796; E 值=1.45e-24; UniProt GO evidence=IDA:AgBaseUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0008270zinc ion binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.866; 覆盖度=49.216; E 值=2.71e-42; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0061630ubiquitin protein ligase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.866; 覆盖度=49.216; E 值=2.71e-42; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G19950KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=47.321; 覆盖度=35.11; E 值=1.2e-24UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G64920KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.866; 覆盖度=49.216; E 值=2.71e-42UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGdosa:Os05g0488800KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=45.455; 覆盖度=31.034; E 值=1.24e-18UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGosa:4339152KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=45.455; 覆盖度=31.034; E 值=1.24e-18UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGxla:444028KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=46.154; 覆盖度=28.527; E 值=2.88e-21UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release