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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDLXL04_006690
当前查询版本OH1004
位置Chr02:22329358-22334110 (-)
描述Similar to DG1: Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g67570%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_006690 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 6 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g67570 参与以SIGF依赖的方式调控早期叶绿体发育和叶绿体基因表达。 暂无已核实直接文献
At1g30610 可能在胚胎发生中起作用。 暂无已核实直接文献
At5g02860 含五肽重复的蛋白 At5g02860。 暂无已核实直接文献
At2g18940 含五肽重复序列蛋白 At2g18940,叶绿体定位。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0009658chloroplast organization生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.953; 覆盖度=72.681; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009793embryo development ending in seed dormancy生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=38.185; 覆盖度=53.327; E 值=3.79e-119; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0010239chloroplast mRNA processing生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=38.185; 覆盖度=53.327; E 值=3.79e-119; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0042793plastid transcription生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.953; 覆盖度=72.681; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009507chloroplast细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.953; 覆盖度=72.681; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003729mRNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=38.185; 覆盖度=53.327; E 值=3.79e-119; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G30610KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=38.185; 覆盖度=53.327; E 值=3.79e-119UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G02860KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=22.863; 覆盖度=50.706; E 值=3.5e-33UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G67570KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.953; 覆盖度=72.681; E 值=0.0UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release