基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_006568 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr02:13550573-13552169 (+) |
| 描述 | Similar to RPA2B: Replication protein A 32 kDa subunit B (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_006568 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g02920 |
DNA 重组、修复和复制所需的复制蛋白 A 复合物 (RPA) 的组成部分。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g24490 |
DNA 重组、修复和复制所需的复制蛋白 A 复合物 的组成部分。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os02g0633400 |
DNA 重组、修复和复制所需的复制蛋白 A 复合物 (RPA) 的组成部分。 | 暂无已核实直接文献 |
Os02g0829100 |
DNA 重组、修复和复制所需的复制蛋白 A 复合物 (RPA) 的组成部分。 | 暂无已核实直接文献 |
Os06g0693300 |
DNA 重组、修复和复制所需的复制蛋白 A 复合物 (RPA) 的组成部分。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000724 | double-strand break repair via homologous recombination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.687; 覆盖度=100.717; E 值=4.99e-85; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006260 | DNA replication | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.687; 覆盖度=100.717; E 值=4.99e-85; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006281 | DNA repair | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=42.647; 覆盖度=97.491; E 值=7.59e-79; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006289 | nucleotide-excision repair | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.687; 覆盖度=100.717; E 值=4.99e-85; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000781 | chromosome, telomeric region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.687; 覆盖度=100.717; E 值=4.99e-85; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.687; 覆盖度=100.717; E 值=4.99e-85; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005662 | DNA replication factor A complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.687; 覆盖度=100.717; E 值=4.99e-85; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0035861 | site of double-strand break | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.687; 覆盖度=100.717; E 值=4.99e-85; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003697 | single-stranded DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.687; 覆盖度=100.717; E 值=4.99e-85; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042162 | telomeric DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.687; 覆盖度=100.717; E 值=4.99e-85; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G24490 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=42.647; 覆盖度=97.491; E 值=7.59e-79 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G02920 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.687; 覆盖度=100.717; E 值=4.99e-85 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0633400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=42.294; 覆盖度=100.0; E 值=1.23e-70 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0829100 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=37.457; 覆盖度=104.301; E 值=2.15e-57 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os06g0693300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=33.962; 覆盖度=75.986; E 值=2.45e-29 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |