基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_005796 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:173541069-173542185 (-) |
| 描述 | Similar to UBC10: Ubiquitin-conjugating enzyme E2 10 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_005796 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 6 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g53300 |
接受 E1 复合物中的泛素并催化其与其他蛋白质的共价连接。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g27960 |
从E1复合物接受类泛素蛋白SUMO/SMT3并催化其共价附加到其他蛋白上。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g64230 |
接受 E1 复合物中的泛素并催化其与其他蛋白质的共价连接。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os02g0261100 |
E2 结合酶与 E3 泛素蛋白连接酶 EL5 结合以介导靶蛋白的泛素化。 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000209 | protein polyubiquitination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=97.297; 覆盖度=100.0; E 值=1.55e-106; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006511 | ubiquitin-dependent protein catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=97.297; 覆盖度=100.0; E 值=1.55e-106; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016567 | protein ubiquitination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=95.946; 覆盖度=100.0; E 值=6.56e-105; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016925 | protein sumoylation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=96.622; 覆盖度=100.0; E 值=3.95e-106; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathway | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=97.297; 覆盖度=100.0; E 值=1.55e-106; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=96.622; 覆盖度=100.0; E 值=6.77e-106; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=96.622; 覆盖度=100.0; E 值=6.77e-106; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004842 | ubiquitin-protein transferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=97.297; 覆盖度=100.0; E 值=1.55e-106; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005524 | ATP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=97.297; 覆盖度=100.0; E 值=1.55e-106; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031625 | ubiquitin protein ligase binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=97.297; 覆盖度=100.0; E 值=1.55e-106; UniProt GO evidence=IPI:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0061631 | ubiquitin conjugating enzyme activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=97.297; 覆盖度=100.0; E 值=1.55e-106; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G64230 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=96.622; 覆盖度=100.0; E 值=6.77e-106 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G27960 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=96.622; 覆盖度=100.0; E 值=3.95e-106 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G53300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=97.297; 覆盖度=100.0; E 值=1.55e-106 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0261100 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=95.946; 覆盖度=100.0; E 值=6.56e-105 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | sly:100301932 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=97.973; 覆盖度=100.0; E 值=1.68e-106 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | sly:101249087 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=97.973; 覆盖度=100.0; E 值=1.68e-106 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |