本页使用教程

基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

下载当前结果

基因 IDLXL04_038833
当前查询版本OH1004
位置Chr09:51626551-51628890 (+)
描述Similar to GRP23: Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g10270 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_038833 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g10270 可能作为转录调节因子,在早期胚胎发生中必需。
At3g49240 可能在胚胎发生中起作用。 暂无已核实直接文献
At3g60980 含五重复肽基序蛋白 At3g60980,线粒体型。 暂无已核实直接文献
At3g60960 含五重复肽基序蛋白 At3g60960,线粒体型。 暂无已核实直接文献
At1g09900 含五重复肽结构蛋白 At1g09900。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0006351DNA-templated transcription生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.24; 覆盖度=73.295; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0006979response to oxidative stress生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=38.421; 覆盖度=53.977; E 值=3.7e-62; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009793embryo development ending in seed dormancy生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.24; 覆盖度=73.295; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009960endosperm development生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=36.023; 覆盖度=75.71; E 值=1.48e-84; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0051301cell division生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.24; 覆盖度=73.295; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005634nucleus细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.24; 覆盖度=73.295; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005739mitochondrion细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.24; 覆盖度=73.295; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009507chloroplast细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=36.023; 覆盖度=75.71; E 值=1.48e-84; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003729mRNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=36.023; 覆盖度=75.71; E 值=1.48e-84; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005524ATP binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=36.023; 覆盖度=75.71; E 值=1.48e-84; UniProt GO evidence=HDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G09900KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=22.36; 覆盖度=68.608; E 值=1.92e-31UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G10270KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.24; 覆盖度=73.295; E 值=0.0UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G49240KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=36.023; 覆盖度=75.71; E 值=1.48e-84UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G60960KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=33.659; 覆盖度=58.239; E 值=2.24e-59UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G60980KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=38.421; 覆盖度=53.977; E 值=3.7e-62UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release