同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00193

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 224

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00193

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00193 Chr04 35195530-48013578 Chr08 10359612-21432966 mixed High 24 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00193`	Chr04:35195530-48013578	Chr08:10359612-21432966	mixed	224	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 224 · 当前范围 201–224 · 页码 2/2

上一页下载全部锚点 TSV

TkA04G175090 → LXL04_035048

96.0%

TkA04G175210 → LXL04_035047

95.3%

TkA04G175510 → LXL04_035045

97.8%

TkA04G175590 → LXL04_035044

99.8%

TkA04G175660 → LXL04_035043

99.8%

TkA04G177490 → LXL04_035037

100.0%

TkA04G177580 → LXL04_035033

98.1%

TkA04G177600 → LXL04_035031

99.7%

TkA04G177640 → LXL04_035029

89.6%

TkA04G177650 → LXL04_035028

98.5%

TkA04G177750 → LXL04_035027

98.7%

TkA04G177920 → LXL04_035021

93.5%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA04G175090`	`LXL04_035048`	`JCVI_TKOH_00193`	96.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA04G175210`	`LXL04_035047`	`JCVI_TKOH_00193`	95.3	100.0 / 89.212	Strict
`TkA04G175510`	`LXL04_035045`	`JCVI_TKOH_00193`	97.8	95.936 / 94.473	Strict
`TkA04G175590`	`LXL04_035044`	`JCVI_TKOH_00193`	99.8	88.571 / 56.128	待复核
`TkA04G175660`	`LXL04_035043`	`JCVI_TKOH_00193`	99.8	92.469 / 85.0	Complex
`TkA04G177490`	`LXL04_035037`	`JCVI_TKOH_00193`	100.0	86.413 / 61.868	Complex
`TkA04G177580`	`LXL04_035033`	`JCVI_TKOH_00193`	98.1	100.0 / 100.0	Complex
`TkA04G177600`	`LXL04_035031`	`JCVI_TKOH_00193`	99.7	100.0 / 100.0	Complex
`TkA04G177640`	`LXL04_035029`	`JCVI_TKOH_00193`	89.6	48.322 / 90.845	待复核
`TkA04G177650`	`LXL04_035028`	`JCVI_TKOH_00193`	98.5	100.0 / 89.693	Complex
`TkA04G177750`	`LXL04_035027`	`JCVI_TKOH_00193`	98.7	100.0 / 95.983	待复核
`TkA04G177920`	`LXL04_035021`	`JCVI_TKOH_00193`	93.5	86.62 / 69.492	Complex
`TkA04G178100`	`LXL04_035022`	`JCVI_TKOH_00193`	97.4	100.0 / 100.0	Strict
`TkA04G178110`	`LXL04_035023`	`JCVI_TKOH_00193`	99.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA04G178280`	`LXL04_035027`	`JCVI_TKOH_00193`	97.9	100.0 / 95.983	待复核
`TkA04G178370`	`LXL04_035028`	`JCVI_TKOH_00193`	96.3	100.0 / 89.693	Complex
`TkA04G178600`	`LXL04_035031`	`JCVI_TKOH_00193`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA04G178610`	`LXL04_035033`	`JCVI_TKOH_00193`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA04G178830`	`LXL04_035037`	`JCVI_TKOH_00193`	99.4	100.0 / 65.37	待复核
`TkA04G180120`	`LXL04_035019`	`JCVI_TKOH_00193`	95.0	87.328 / 57.143	待复核
`TkA04G180360`	`LXL04_035016`	`JCVI_TKOH_00193`	99.6	99.81 / 74.822	Complex
`TkA04G180420`	`LXL04_035015`	`JCVI_TKOH_00193`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA04G183730`	`LXL04_035002`	`JCVI_TKOH_00193`	99.6	100.0 / 100.0	Complex
`TkA04G185770`	`LXL04_035000`	`JCVI_TKOH_00193`	98.9	80.357 / 100.0	Strict