同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00424

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 13

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00424

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00424 ChrUn 10149463-10460948 Chr09 15099785-15440418 + High 13 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00424`	ChrUn:10149463-10460948	Chr09:15099785-15440418	+	13	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 13 · 当前范围 1–13 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkAUNG037140 → LXL04_037573

99.4%

TkAUNG037440 → LXL04_037574

98.0%

TkAUNG037460 → LXL04_037575

70.1%

TkAUNG037550 → LXL04_037577

95.1%

TkAUNG037560 → LXL04_037577

52.3%

TkAUNG037920 → LXL04_037578

98.8%

TkAUNG037940 → LXL04_037579

99.7%

TkAUNG038000 → LXL04_037581

100.0%

TkAUNG038180 → LXL04_037583

99.4%

TkAUNG038190 → LXL04_037582

100.0%

TkAUNG038250 → LXL04_037586

96.0%

TkAUNG038260 → LXL04_037584

100.0%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkAUNG037140`	`LXL04_037573`	`JCVI_TKOH_00424`	99.4	100.0 / 100.0	待复核
`TkAUNG037440`	`LXL04_037574`	`JCVI_TKOH_00424`	98.0	100.0 / 100.0	待复核
`TkAUNG037460`	`LXL04_037575`	`JCVI_TKOH_00424`	70.1	91.803 / 99.485	待复核
`TkAUNG037550`	`LXL04_037577`	`JCVI_TKOH_00424`	95.1	97.921 / 86.27	Complex
`TkAUNG037560`	`LXL04_037577`	`JCVI_TKOH_00424`	52.3	87.571 / 34.426	Complex
`TkAUNG037920`	`LXL04_037578`	`JCVI_TKOH_00424`	98.8	100.0 / 100.0	Complex
`TkAUNG037940`	`LXL04_037579`	`JCVI_TKOH_00424`	99.7	98.182 / 100.0	待复核
`TkAUNG038000`	`LXL04_037581`	`JCVI_TKOH_00424`	100.0	53.472 / 22.985	Complex
`TkAUNG038180`	`LXL04_037583`	`JCVI_TKOH_00424`	99.4	92.647 / 26.185	待复核
`TkAUNG038190`	`LXL04_037582`	`JCVI_TKOH_00424`	100.0	89.63 / 65.405	Complex
`TkAUNG038250`	`LXL04_037586`	`JCVI_TKOH_00424`	96.0	100.0 / 72.754	Complex
`TkAUNG038260`	`LXL04_037584`	`JCVI_TKOH_00424`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkAUNG038430`	`LXL04_037586`	`JCVI_TKOH_00424`	99.7	100.0 / 100.0	待复核