同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00417

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 17

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00417

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00417 ChrUn 8463434-9254421 Chr08 40339166-41074631 mixed High 17 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00417`	ChrUn:8463434-9254421	Chr08:40339166-41074631	mixed	17	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 17 · 当前范围 1–17 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkAUNG031440 → LXL04_036381

89.8%

TkAUNG031470 → LXL04_036380

100.0%

TkAUNG031480 → LXL04_036379

99.2%

TkAUNG031490 → LXL04_036378

100.0%

TkAUNG031550 → LXL04_036377

99.8%

TkAUNG031560 → LXL04_036376

94.2%

TkAUNG031570 → LXL04_036375

99.7%

TkAUNG031580 → LXL04_036374

71.1%

TkAUNG031730 → LXL04_036373

100.0%

TkAUNG032300 → LXL04_036369

99.8%

TkAUNG032360 → LXL04_036367

99.5%

TkAUNG032410 → LXL04_036363

100.0%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkAUNG031440`	`LXL04_036381`	`JCVI_TKOH_00417`	89.8	100.0 / 96.591	Complex
`TkAUNG031470`	`LXL04_036380`	`JCVI_TKOH_00417`	100.0	100.0 / 100.0	待复核
`TkAUNG031480`	`LXL04_036379`	`JCVI_TKOH_00417`	99.2	100.0 / 91.034	待复核
`TkAUNG031490`	`LXL04_036378`	`JCVI_TKOH_00417`	100.0	100.0 / 100.0	待复核
`TkAUNG031550`	`LXL04_036377`	`JCVI_TKOH_00417`	99.8	96.825 / 100.0	Complex
`TkAUNG031560`	`LXL04_036376`	`JCVI_TKOH_00417`	94.2	100.0 / 100.0	Complex
`TkAUNG031570`	`LXL04_036375`	`JCVI_TKOH_00417`	99.7	100.0 / 100.0	Complex
`TkAUNG031580`	`LXL04_036374`	`JCVI_TKOH_00417`	71.1	98.507 / 74.373	待复核
`TkAUNG031730`	`LXL04_036373`	`JCVI_TKOH_00417`	100.0	100.0 / 48.786	待复核
`TkAUNG032300`	`LXL04_036369`	`JCVI_TKOH_00417`	99.8	100.0 / 100.0	Complex
`TkAUNG032360`	`LXL04_036367`	`JCVI_TKOH_00417`	99.5	99.548 / 39.497	待复核
`TkAUNG032410`	`LXL04_036363`	`JCVI_TKOH_00417`	100.0	100.0 / 19.74	待复核
`TkAUNG032500`	`LXL04_036362`	`JCVI_TKOH_00417`	100.0	100.0 / 100.0	待复核
`TkAUNG032550`	`LXL04_036361`	`JCVI_TKOH_00417`	73.6	100.0 / 90.317	Complex
`TkAUNG033490`	`LXL04_036343`	`JCVI_TKOH_00417`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkAUNG034160`	`LXL04_036342`	`JCVI_TKOH_00417`	98.1	100.0 / 94.495	Complex
`TkAUNG034180`	`LXL04_036339`	`JCVI_TKOH_00417`	51.3	99.094 / 15.903	Complex