同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

证据边界:TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料,本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照,不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点,后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块
427
ID 对照记录
84884
高置信区块
302
中置信区块
125
参考材料组装基因数gap 数端粒扫描
TK1151 TK1151_GWHBCHF00000000 45224 1917 0/9
OH-1004 OH1004_GCA_047496595.1 40057 131 0/711

查询解析

输入 ID
JCVI_TKOH_00395
解析类型
区块 ID
ID 对照 + 共线性联合证据
解析到的基因
无
未能直接匹配到橡胶草基因目录
关联结果
0 / 1 / 9
对照 / 区块 / 锚点
最佳区块: JCVI_TKOH_00395

当前输入已解析为共线性区块 ID,下面优先展示区块范围和锚点基因。

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00395 ChrUn 17560903-17688756 Chr03 18382533-18499975 + High 9 anchors
ChrUn 17560903-17688756 Chr03 18382533-18499975 JCVI_TKOH_00395 · 9 gene pairs TkAUNG060240 | LXL04_012764 | 99.1% | sequence_supported_annotation_or_model_conflict | Review TkAUNG060340 | LXL04_012766 | 100.0% | RBH_below_probable_coverage_or_synteny_threshold | Review TkAUNG060590 | LXL04_012767 | 100.0% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkAUNG060640 | LXL04_012768 | 94.6% | RBH_sequence_supported | Probable TkAUNG060680 | LXL04_012770 | 70.6% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkAUNG060720 | LXL04_012771 | 99.7% | RBH_high_identity_coverage_local_synteny_minor_chr_pair | Probable TkAUNG060730 | LXL04_012772 | 99.9% | RBH_sequence_supported | Probable TkAUNG060740 | LXL04_012773 | 99.2% | sequence_supported_annotation_or_model_conflict | Review TkAUNG060750 | LXL04_012773 | 96.3% | sequence_supported_annotation_or_model_conflict | Review
High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点
锚点表按页展示,TSV 下载包含当前查询的全部锚点;上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块查询位置目标位置方向当前映射锚点数置信等级备注
JCVI_TKOH_00395 ChrUn:17560903-17688756 Chr03:18382533-18499975 + 9 高置信 Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 9 · 当前范围 1–9 · 页码 1/1

TkAUNG060240 → LXL04_012764
99.1%
TkAUNG060340 → LXL04_012766
100.0%
TkAUNG060590 → LXL04_012767
100.0%
TkAUNG060640 → LXL04_012768
94.6%
TkAUNG060680 → LXL04_012770
70.6%
TkAUNG060720 → LXL04_012771
99.7%
TkAUNG060730 → LXL04_012772
99.9%
TkAUNG060740 → LXL04_012773
99.2%
TkAUNG060750 → LXL04_012773
96.3%
TK1151 基因OH-1004 基因区块一致性覆盖度置信等级
TkAUNG060240LXL04_012764JCVI_TKOH_0039599.194.643 / 57.923待复核
TkAUNG060340LXL04_012766JCVI_TKOH_00395100.074.519 / 55.16待复核
TkAUNG060590LXL04_012767JCVI_TKOH_00395100.0100.0 / 100.0Complex
TkAUNG060640LXL04_012768JCVI_TKOH_0039594.6100.0 / 100.0Probable
TkAUNG060680LXL04_012770JCVI_TKOH_0039570.699.871 / 89.671Complex
TkAUNG060720LXL04_012771JCVI_TKOH_0039599.7100.0 / 100.0Probable
TkAUNG060730LXL04_012772JCVI_TKOH_0039599.9100.0 / 74.278Probable
TkAUNG060740LXL04_012773JCVI_TKOH_0039599.298.413 / 34.831待复核
TkAUNG060750LXL04_012773JCVI_TKOH_0039596.399.474 / 53.09待复核