同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00374

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 15

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00374

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00374 ChrUn 11741909-12103923 Chr01 73075385-74534231 mixed High 15 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00374`	ChrUn:11741909-12103923	Chr01:73075385-74534231	mixed	15	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 15 · 当前范围 1–15 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkAUNG042210 → LXL04_003307

87.9%

TkAUNG042230 → LXL04_003306

95.5%

TkAUNG042280 → LXL04_003307

99.7%

TkAUNG042440 → LXL04_003307

95.9%

TkAUNG042450 → LXL04_003306

95.5%

TkAUNG042490 → LXL04_003307

98.7%

TkAUNG042640 → LXL04_003306

95.5%

TkAUNG042650 → LXL04_003307

84.0%

TkAUNG042660 → LXL04_003305

99.1%

TkAUNG042730 → LXL04_003305

99.7%

TkAUNG042890 → LXL04_003300

92.7%

TkAUNG042910 → LXL04_003300

92.2%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkAUNG042210`	`LXL04_003307`	`JCVI_TKOH_00374`	87.9	85.973 / 21.319	Complex
`TkAUNG042230`	`LXL04_003306`	`JCVI_TKOH_00374`	95.5	90.411 / 50.19	待复核
`TkAUNG042280`	`LXL04_003307`	`JCVI_TKOH_00374`	99.7	99.373 / 37.338	待复核
`TkAUNG042440`	`LXL04_003307`	`JCVI_TKOH_00374`	95.9	99.373 / 37.338	待复核
`TkAUNG042450`	`LXL04_003306`	`JCVI_TKOH_00374`	95.5	90.411 / 50.19	待复核
`TkAUNG042490`	`LXL04_003307`	`JCVI_TKOH_00374`	98.7	99.123 / 26.62	待复核
`TkAUNG042640`	`LXL04_003306`	`JCVI_TKOH_00374`	95.5	90.411 / 50.19	待复核
`TkAUNG042650`	`LXL04_003307`	`JCVI_TKOH_00374`	84.0	99.433 / 37.338	Complex
`TkAUNG042660`	`LXL04_003305`	`JCVI_TKOH_00374`	99.1	99.373 / 81.701	待复核
`TkAUNG042730`	`LXL04_003305`	`JCVI_TKOH_00374`	99.7	99.373 / 81.701	待复核
`TkAUNG042890`	`LXL04_003300`	`JCVI_TKOH_00374`	92.7	91.667 / 23.272	Complex
`TkAUNG042910`	`LXL04_003300`	`JCVI_TKOH_00374`	92.2	96.057 / 37.8	待复核
`TkAUNG043200`	`LXL04_003282`	`JCVI_TKOH_00374`	97.7	100.0 / 100.0	Strict
`TkAUNG043490`	`LXL04_003311`	`JCVI_TKOH_00374`	99.4	100.0 / 100.0	待复核
`TkAUNG043520`	`LXL04_003310`	`JCVI_TKOH_00374`	86.3	94.485 / 72.152	待复核