同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00362

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 13

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00362

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00362 Chr08 103923535-104564888 Chr07 92806417-93424932 + High 13 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00362`	Chr08:103923535-104564888	Chr07:92806417-93424932	+	13	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 13 · 当前范围 1–13 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA08G408260 → LXL04_034239

99.2%

TkA08G408270 → LXL04_034240

98.9%

TkA08G408420 → LXL04_034240

75.2%

TkA08G409010 → LXL04_034240

77.9%

TkA08G409070 → LXL04_034243

96.5%

TkA08G409240 → LXL04_034244

99.2%

TkA08G409270 → LXL04_034245

97.1%

TkA08G409780 → LXL04_034247

98.5%

TkA08G409980 → LXL04_034249

99.1%

TkA08G410010 → LXL04_034250

89.4%

TkA08G410220 → LXL04_034252

97.4%

TkA08G410330 → LXL04_034253

95.5%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA08G408260`	`LXL04_034239`	`JCVI_TKOH_00362`	99.2	95.61 / 73.913	Probable
`TkA08G408270`	`LXL04_034240`	`JCVI_TKOH_00362`	98.9	100.0 / 100.0	Strict
`TkA08G408420`	`LXL04_034240`	`JCVI_TKOH_00362`	75.2	83.237 / 37.666	Complex
`TkA08G409010`	`LXL04_034240`	`JCVI_TKOH_00362`	77.9	96.277 / 48.011	Complex
`TkA08G409070`	`LXL04_034243`	`JCVI_TKOH_00362`	96.5	100.0 / 100.0	待复核
`TkA08G409240`	`LXL04_034244`	`JCVI_TKOH_00362`	99.2	100.0 / 100.0	待复核
`TkA08G409270`	`LXL04_034245`	`JCVI_TKOH_00362`	97.1	100.0 / 95.085	Strict
`TkA08G409780`	`LXL04_034247`	`JCVI_TKOH_00362`	98.5	98.297 / 92.449	Strict
`TkA08G409980`	`LXL04_034249`	`JCVI_TKOH_00362`	99.1	97.699 / 98.312	Strict
`TkA08G410010`	`LXL04_034250`	`JCVI_TKOH_00362`	89.4	94.419 / 26.038	待复核
`TkA08G410220`	`LXL04_034252`	`JCVI_TKOH_00362`	97.4	100.0 / 100.0	Strict
`TkA08G410330`	`LXL04_034253`	`JCVI_TKOH_00362`	95.5	100.0 / 100.0	Strict
`TkA08G410370`	`LXL04_034255`	`JCVI_TKOH_00362`	99.2	100.0 / 100.0	Strict