同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00285

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 15

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00285

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00285 Chr06 103314218-103776916 Chr05 16642781-17229942 mixed High 15 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00285`	Chr06:103314218-103776916	Chr05:16642781-17229942	mixed	15	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 15 · 当前范围 1–15 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA06G417430 → LXL04_023008

86.9%

TkA06G417610 → LXL04_023007

99.6%

TkA06G417900 → LXL04_023006

95.1%

TkA06G417910 → LXL04_023006

99.2%

TkA06G417920 → LXL04_023005

99.2%

TkA06G418510 → LXL04_023004

99.5%

TkA06G418600 → LXL04_023004

96.0%

TkA06G418630 → LXL04_023002

99.2%

TkA06G418640 → LXL04_023001

95.5%

TkA06G418660 → LXL04_022999

97.2%

TkA06G418800 → LXL04_022999

98.6%

TkA06G419080 → LXL04_022998

91.9%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA06G417430`	`LXL04_023008`	`JCVI_TKOH_00285`	86.9	93.86 / 86.29	待复核
`TkA06G417610`	`LXL04_023007`	`JCVI_TKOH_00285`	99.6	97.595 / 91.318	Strict
`TkA06G417900`	`LXL04_023006`	`JCVI_TKOH_00285`	95.1	100.0 / 50.0	待复核
`TkA06G417910`	`LXL04_023006`	`JCVI_TKOH_00285`	99.2	98.084 / 32.821	待复核
`TkA06G417920`	`LXL04_023005`	`JCVI_TKOH_00285`	99.2	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G418510`	`LXL04_023004`	`JCVI_TKOH_00285`	99.5	99.49 / 49.872	待复核
`TkA06G418600`	`LXL04_023004`	`JCVI_TKOH_00285`	96.0	98.295 / 44.246	待复核
`TkA06G418630`	`LXL04_023002`	`JCVI_TKOH_00285`	99.2	100.0 / 91.753	Strict
`TkA06G418640`	`LXL04_023001`	`JCVI_TKOH_00285`	95.5	100.0 / 52.599	待复核
`TkA06G418660`	`LXL04_022999`	`JCVI_TKOH_00285`	97.2	100.0 / 99.169	Complex
`TkA06G418800`	`LXL04_022999`	`JCVI_TKOH_00285`	98.6	100.0 / 99.169	Complex
`TkA06G419080`	`LXL04_022998`	`JCVI_TKOH_00285`	91.9	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G419100`	`LXL04_022996`	`JCVI_TKOH_00285`	98.9	99.725 / 97.574	Strict
`TkA06G419110`	`LXL04_022997`	`JCVI_TKOH_00285`	98.2	99.834 / 99.667	Strict
`TkA06G419210`	`LXL04_022995`	`JCVI_TKOH_00285`	92.7	88.94 / 100.0	Complex