同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00236

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 16

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00236

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00236 Chr05 40331869-44157106 Chr04 62188760-66050144 mixed High 16 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00236`	Chr05:40331869-44157106	Chr04:62188760-66050144	mixed	16	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 16 · 当前范围 1–16 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA05G155900 → LXL04_020267

97.3%

TkA05G159500 → LXL04_020272

100.0%

TkA05G159510 → LXL04_020273

97.2%

TkA05G159850 → LXL04_020278

100.0%

TkA05G162320 → LXL04_020278

100.0%

TkA05G162570 → LXL04_020298

100.0%

TkA05G163600 → LXL04_020300

99.4%

TkA05G163610 → LXL04_020303

55.0%

TkA05G164390 → LXL04_020308

92.3%

TkA05G164460 → LXL04_020309

81.5%

TkA05G167780 → LXL04_020317

96.1%

TkA05G168250 → LXL04_020318

99.6%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA05G155900`	`LXL04_020267`	`JCVI_TKOH_00236`	97.3	99.281 / 55.87	待复核
`TkA05G159500`	`LXL04_020272`	`JCVI_TKOH_00236`	100.0	77.326 / 33.586	待复核
`TkA05G159510`	`LXL04_020273`	`JCVI_TKOH_00236`	97.2	100.0 / 100.0	Strict
`TkA05G159850`	`LXL04_020278`	`JCVI_TKOH_00236`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA05G162320`	`LXL04_020278`	`JCVI_TKOH_00236`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA05G162570`	`LXL04_020298`	`JCVI_TKOH_00236`	100.0	99.225 / 20.645	待复核
`TkA05G163600`	`LXL04_020300`	`JCVI_TKOH_00236`	99.4	78.845 / 96.78	Probable
`TkA05G163610`	`LXL04_020303`	`JCVI_TKOH_00236`	55.0	53.028 / 85.736	待复核
`TkA05G164390`	`LXL04_020308`	`JCVI_TKOH_00236`	92.3	99.498 / 55.138	待复核
`TkA05G164460`	`LXL04_020309`	`JCVI_TKOH_00236`	81.5	100.0 / 100.0	待复核
`TkA05G167780`	`LXL04_020317`	`JCVI_TKOH_00236`	96.1	100.0 / 100.0	Strict
`TkA05G168250`	`LXL04_020318`	`JCVI_TKOH_00236`	99.6	100.0 / 100.0	待复核
`TkA05G168300`	`LXL04_020321`	`JCVI_TKOH_00236`	98.9	100.0 / 100.0	待复核
`TkA05G169310`	`LXL04_020318`	`JCVI_TKOH_00236`	98.8	100.0 / 100.0	待复核
`TkA05G169380`	`LXL04_020321`	`JCVI_TKOH_00236`	98.9	100.0 / 100.0	待复核
`TkA05G172260`	`LXL04_020323`	`JCVI_TKOH_00236`	96.0	95.42 / 59.809	待复核