同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00133

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 8

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00133

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00133 Chr03 52618652-53234303 Chr02 58793963-59372643 + High 8 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00133`	Chr03:52618652-53234303	Chr02:58793963-59372643	+	8	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 8 · 当前范围 1–8 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA03G209730 → LXL04_007737

100.0%

TkA03G210130 → LXL04_007739

99.7%

TkA03G210800 → LXL04_007759

88.1%

TkA03G211000 → LXL04_007751

85.5%

TkA03G211430 → LXL04_007761

88.7%

TkA03G211790 → LXL04_007745

94.1%

TkA03G211940 → LXL04_007756

98.4%

TkA03G212250 → LXL04_007761

98.2%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA03G209730`	`LXL04_007737`	`JCVI_TKOH_00133`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA03G210130`	`LXL04_007739`	`JCVI_TKOH_00133`	99.7	100.0 / 100.0	Complex
`TkA03G210800`	`LXL04_007759`	`JCVI_TKOH_00133`	88.1	89.667 / 63.755	待复核
`TkA03G211000`	`LXL04_007751`	`JCVI_TKOH_00133`	85.5	44.516 / 70.408	待复核
`TkA03G211430`	`LXL04_007761`	`JCVI_TKOH_00133`	88.7	100.0 / 99.408	Complex
`TkA03G211790`	`LXL04_007745`	`JCVI_TKOH_00133`	94.1	100.0 / 100.0	Complex
`TkA03G211940`	`LXL04_007756`	`JCVI_TKOH_00133`	98.4	100.0 / 100.0	待复核
`TkA03G212250`	`LXL04_007761`	`JCVI_TKOH_00133`	98.2	100.0 / 98.225	待复核