同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00054

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 15

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00054

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00054 Chr01 78613324-79549578 Chr07 47060578-47814229 mixed High 15 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00054`	Chr01:78613324-79549578	Chr07:47060578-47814229	mixed	15	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 15 · 当前范围 1–15 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA01G317960 → LXL04_033537

99.1%

TkA01G318120 → LXL04_033540

71.8%

TkA01G318260 → LXL04_033541

97.1%

TkA01G318300 → LXL04_033545

100.0%

TkA01G318800 → LXL04_033548

100.0%

TkA01G319460 → LXL04_033552

89.6%

TkA01G319510 → LXL04_033553

98.9%

TkA01G319530 → LXL04_033556

96.1%

TkA01G319550 → LXL04_033557

99.4%

TkA01G319560 → LXL04_033558

96.6%

TkA01G319590 → LXL04_033560

97.8%

TkA01G319630 → LXL04_033561

97.4%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA01G317960`	`LXL04_033537`	`JCVI_TKOH_00054`	99.1	71.341 / 60.0	Complex
`TkA01G318120`	`LXL04_033540`	`JCVI_TKOH_00054`	71.8	62.671 / 68.635	Complex
`TkA01G318260`	`LXL04_033541`	`JCVI_TKOH_00054`	97.1	100.0 / 100.0	Complex
`TkA01G318300`	`LXL04_033545`	`JCVI_TKOH_00054`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA01G318800`	`LXL04_033548`	`JCVI_TKOH_00054`	100.0	100.0 / 56.757	待复核
`TkA01G319460`	`LXL04_033552`	`JCVI_TKOH_00054`	89.6	85.437 / 86.099	Complex
`TkA01G319510`	`LXL04_033553`	`JCVI_TKOH_00054`	98.9	81.034 / 21.759	Complex
`TkA01G319530`	`LXL04_033556`	`JCVI_TKOH_00054`	96.1	91.233 / 72.391	Complex
`TkA01G319550`	`LXL04_033557`	`JCVI_TKOH_00054`	99.4	93.785 / 77.934	Probable
`TkA01G319560`	`LXL04_033558`	`JCVI_TKOH_00054`	96.6	95.84 / 67.899	待复核
`TkA01G319590`	`LXL04_033560`	`JCVI_TKOH_00054`	97.8	100.0 / 100.0	Complex
`TkA01G319630`	`LXL04_033561`	`JCVI_TKOH_00054`	97.4	99.943 / 95.442	Complex
`TkA01G319650`	`LXL04_033562`	`JCVI_TKOH_00054`	100.0	100.0 / 100.0	Probable
`TkA01G319790`	`LXL04_033563`	`JCVI_TKOH_00054`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA01G320270`	`LXL04_033568`	`JCVI_TKOH_00054`	96.5	27.737 / 37.134	Complex