同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00003

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 21

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00003

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00003 Chr01 7210066-7919350 Chr01 169148327-169843587 mixed High 21 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00003`	Chr01:7210066-7919350	Chr01:169148327-169843587	mixed	21	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 21 · 当前范围 1–21 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA01G028230 → LXL04_005607

56.1%

TkA01G028250 → LXL04_005608

100.0%

TkA01G028270 → LXL04_005609

100.0%

TkA01G028340 → LXL04_005610

100.0%

TkA01G028390 → LXL04_005612

96.7%

TkA01G028540 → LXL04_005615

97.0%

TkA01G028810 → LXL04_005618

97.7%

TkA01G028930 → LXL04_005619

90.7%

TkA01G028940 → LXL04_005620

100.0%

TkA01G028960 → LXL04_005621

98.6%

TkA01G028970 → LXL04_005624

89.7%

TkA01G029140 → LXL04_005626

94.0%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA01G028230`	`LXL04_005607`	`JCVI_TKOH_00003`	56.1	23.347 / 11.48	Complex
`TkA01G028250`	`LXL04_005608`	`JCVI_TKOH_00003`	100.0	99.702 / 97.668	Strict
`TkA01G028270`	`LXL04_005609`	`JCVI_TKOH_00003`	100.0	100.0 / 48.958	待复核
`TkA01G028340`	`LXL04_005610`	`JCVI_TKOH_00003`	100.0	88.308 / 85.928	Strict
`TkA01G028390`	`LXL04_005612`	`JCVI_TKOH_00003`	96.7	99.397 / 100.0	Strict
`TkA01G028540`	`LXL04_005615`	`JCVI_TKOH_00003`	97.0	100.0 / 96.403	待复核
`TkA01G028810`	`LXL04_005618`	`JCVI_TKOH_00003`	97.7	68.75 / 75.862	待复核
`TkA01G028930`	`LXL04_005619`	`JCVI_TKOH_00003`	90.7	93.371 / 100.0	Probable
`TkA01G028940`	`LXL04_005620`	`JCVI_TKOH_00003`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G028960`	`LXL04_005621`	`JCVI_TKOH_00003`	98.6	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G028970`	`LXL04_005624`	`JCVI_TKOH_00003`	89.7	99.594 / 98.687	待复核
`TkA01G029140`	`LXL04_005626`	`JCVI_TKOH_00003`	94.0	98.661 / 70.393	Probable
`TkA01G029380`	`LXL04_005630`	`JCVI_TKOH_00003`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G030090`	`LXL04_005633`	`JCVI_TKOH_00003`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G030240`	`LXL04_005636`	`JCVI_TKOH_00003`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G030260`	`LXL04_005637`	`JCVI_TKOH_00003`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G030350`	`LXL04_005639`	`JCVI_TKOH_00003`	99.2	100.0 / 83.562	待复核
`TkA01G030360`	`LXL04_005640`	`JCVI_TKOH_00003`	98.3	100.0 / 100.0	待复核
`TkA01G030370`	`LXL04_005641`	`JCVI_TKOH_00003`	95.6	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G030750`	`LXL04_005643`	`JCVI_TKOH_00003`	100.0	100.0 / 86.096	Strict
`TkA01G030790`	`LXL04_005644`	`JCVI_TKOH_00003`	99.7	100.0 / 59.167	待复核