同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00272

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 428

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00272

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00272 Chr06 21699631-41102326 Chr05 87809389-105841807 mixed High 28 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00272`	Chr06:21699631-41102326	Chr05:87809389-105841807	mixed	428	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 428 · 当前范围 401–428 · 页码 3/3

上一页下载全部锚点 TSV

TkA06G147660 → LXL04_024398

99.3%

TkA06G148070 → LXL04_024395

100.0%

TkA06G148080 → LXL04_024395

100.0%

TkA06G148090 → LXL04_024394

99.4%

TkA06G149770 → LXL04_024386

91.0%

TkA06G149780 → LXL04_024385

91.1%

TkA06G150190 → LXL04_024383

98.9%

TkA06G150200 → LXL04_024382

94.6%

TkA06G150480 → LXL04_024377

99.7%

TkA06G150490 → LXL04_024376

98.7%

TkA06G150780 → LXL04_024374

95.8%

TkA06G151990 → LXL04_024371

100.0%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA06G147660`	`LXL04_024398`	`JCVI_TKOH_00272`	99.3	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G148070`	`LXL04_024395`	`JCVI_TKOH_00272`	100.0	64.322 / 28.132	Complex
`TkA06G148080`	`LXL04_024395`	`JCVI_TKOH_00272`	100.0	86.957 / 21.978	待复核
`TkA06G148090`	`LXL04_024394`	`JCVI_TKOH_00272`	99.4	79.821 / 97.79	Complex
`TkA06G149770`	`LXL04_024386`	`JCVI_TKOH_00272`	91.0	100.0 / 100.0	Probable
`TkA06G149780`	`LXL04_024385`	`JCVI_TKOH_00272`	91.1	100.0 / 82.807	Probable
`TkA06G150190`	`LXL04_024383`	`JCVI_TKOH_00272`	98.9	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G150200`	`LXL04_024382`	`JCVI_TKOH_00272`	94.6	100.0 / 100.0	Probable
`TkA06G150480`	`LXL04_024377`	`JCVI_TKOH_00272`	99.7	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G150490`	`LXL04_024376`	`JCVI_TKOH_00272`	98.7	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G150780`	`LXL04_024374`	`JCVI_TKOH_00272`	95.8	99.702 / 89.589	Complex
`TkA06G151990`	`LXL04_024371`	`JCVI_TKOH_00272`	100.0	46.753 / 39.344	待复核
`TkA06G152040`	`LXL04_024368`	`JCVI_TKOH_00272`	99.5	94.802 / 100.0	Complex
`TkA06G152050`	`LXL04_024367`	`JCVI_TKOH_00272`	89.3	94.034 / 68.199	待复核
`TkA06G152060`	`LXL04_024366`	`JCVI_TKOH_00272`	98.6	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G152130`	`LXL04_024365`	`JCVI_TKOH_00272`	98.4	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G152490`	`LXL04_024364`	`JCVI_TKOH_00272`	68.5	85.606 / 95.858	Complex
`TkA06G152640`	`LXL04_024362`	`JCVI_TKOH_00272`	99.8	99.512 / 100.0	Strict
`TkA06G152660`	`LXL04_024360`	`JCVI_TKOH_00272`	91.7	100.0 / 100.0	Probable
`TkA06G152850`	`LXL04_024358`	`JCVI_TKOH_00272`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G152860`	`LXL04_024357`	`JCVI_TKOH_00272`	87.5	100.0 / 100.0	待复核
`TkA06G152870`	`LXL04_024356`	`JCVI_TKOH_00272`	89.3	100.0 / 77.059	Complex
`TkA06G153070`	`LXL04_024355`	`JCVI_TKOH_00272`	99.2	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G154050`	`LXL04_024350`	`JCVI_TKOH_00272`	98.6	100.0 / 97.576	Complex
`TkA06G154300`	`LXL04_024346`	`JCVI_TKOH_00272`	99.2	100.0 / 97.244	待复核
`TkA06G154580`	`LXL04_024345`	`JCVI_TKOH_00272`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G154590`	`LXL04_024344`	`JCVI_TKOH_00272`	99.3	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G154900`	`LXL04_024342`	`JCVI_TKOH_00272`	59.7	72.642 / 22.917	Complex