同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00002

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 230

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00002

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00002 Chr01 208656-7221575 Chr01 169916072-176955451 mixed High 30 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00002`	Chr01:208656-7221575	Chr01:169916072-176955451	mixed	230	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 230 · 当前范围 201–230 · 页码 2/2

上一页下载全部锚点 TSV

TkA01G023590 → LXL04_005690

92.2%

TkA01G023820 → LXL04_005688

98.2%

TkA01G023840 → LXL04_005687

99.8%

TkA01G023850 → LXL04_005683

92.9%

TkA01G023860 → LXL04_005682

97.0%

TkA01G023920 → LXL04_005681

98.3%

TkA01G023930 → LXL04_005680

91.4%

TkA01G024000 → LXL04_005678

99.4%

TkA01G024010 → LXL04_005677

99.3%

TkA01G024020 → LXL04_005676

97.5%

TkA01G024050 → LXL04_005675

100.0%

TkA01G024060 → LXL04_005674

94.5%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA01G023590`	`LXL04_005690`	`JCVI_TKOH_00002`	92.2	100.0 / 100.0	Probable
`TkA01G023820`	`LXL04_005688`	`JCVI_TKOH_00002`	98.2	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G023840`	`LXL04_005687`	`JCVI_TKOH_00002`	99.8	100.0 / 87.169	Complex
`TkA01G023850`	`LXL04_005683`	`JCVI_TKOH_00002`	92.9	100.0 / 97.143	Probable
`TkA01G023860`	`LXL04_005682`	`JCVI_TKOH_00002`	97.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G023920`	`LXL04_005681`	`JCVI_TKOH_00002`	98.3	100.0 / 100.0	Complex
`TkA01G023930`	`LXL04_005680`	`JCVI_TKOH_00002`	91.4	91.866 / 100.0	Complex
`TkA01G024000`	`LXL04_005678`	`JCVI_TKOH_00002`	99.4	100.0 / 100.0	Complex
`TkA01G024010`	`LXL04_005677`	`JCVI_TKOH_00002`	99.3	100.0 / 97.833	Complex
`TkA01G024020`	`LXL04_005676`	`JCVI_TKOH_00002`	97.5	97.115 / 60.479	Complex
`TkA01G024050`	`LXL04_005675`	`JCVI_TKOH_00002`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA01G024060`	`LXL04_005674`	`JCVI_TKOH_00002`	94.5	100.0 / 100.0	Complex
`TkA01G024070`	`LXL04_005671`	`JCVI_TKOH_00002`	86.0	100.0 / 24.371	Complex
`TkA01G024080`	`LXL04_005672`	`JCVI_TKOH_00002`	99.0	100.0 / 100.0	待复核
`TkA01G024290`	`LXL04_005669`	`JCVI_TKOH_00002`	97.2	100.0 / 100.0	Complex
`TkA01G024300`	`LXL04_005668`	`JCVI_TKOH_00002`	99.7	100.0 / 100.0	Complex
`TkA01G024310`	`LXL04_005667`	`JCVI_TKOH_00002`	92.1	100.0 / 100.0	Complex
`TkA01G024430`	`LXL04_005665`	`JCVI_TKOH_00002`	100.0	100.0 / 100.0	待复核
`TkA01G024490`	`LXL04_005660`	`JCVI_TKOH_00002`	82.1	100.0 / 100.0	Complex
`TkA01G024800`	`LXL04_005662`	`JCVI_TKOH_00002`	99.5	100.0 / 78.776	Complex
`TkA01G024930`	`LXL04_005660`	`JCVI_TKOH_00002`	92.9	100.0 / 100.0	Complex
`TkA01G025740`	`LXL04_005662`	`JCVI_TKOH_00002`	99.5	97.872 / 75.102	Complex
`TkA01G025830`	`LXL04_005660`	`JCVI_TKOH_00002`	100.0	87.225 / 93.396	Complex
`TkA01G026750`	`LXL04_005658`	`JCVI_TKOH_00002`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G027280`	`LXL04_005653`	`JCVI_TKOH_00002`	81.2	100.0 / 90.56	待复核
`TkA01G027660`	`LXL04_005652`	`JCVI_TKOH_00002`	97.4	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G027970`	`LXL04_005650`	`JCVI_TKOH_00002`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G028000`	`LXL04_005648`	`JCVI_TKOH_00002`	97.7	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G028130`	`LXL04_005645`	`JCVI_TKOH_00002`	59.3	75.168 / 10.373	Complex
`TkA01G028170`	`LXL04_005645`	`JCVI_TKOH_00002`	80.6	76.923 / 18.026	Complex