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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G278080
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 72305494-72308168 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1432 bp · TkA08G278080|TK1151|cDNA

GGAGATTTTACAAGAAAAACGCGGTCGGAGCTACCGTATAAAGTATTAACCCCGAAAATTCAGCAAAACTTACATCGCCATTCGCAATTTTGTCAGATCTCTCGTCAAATTTCTTCAAGTCGCCAGCGTTTTCTCACAAGGGTACGATTCATATGGGGATCTTGTTCAATTATATATTGGTAAAAAATAGCGCCGACCCCTCAACATTCACCAAGACCATTTGAAATTTTTGAGAAATCCCAAGTCTCGACTTCCCTGTT...

CDS

下载 CDS FASTA

618 bp · TkA08G278080|TK1151|CDS

ATGGGGACTGTTGTTGATTCTGCAAACAAGGAAGGAACCAAAAGTGTTCTTAGTGTAAAGAAGCCGAGAGTTGTGTTTGTCCTAGGAGGTCCTGGAAGTGGTAAGGGCACCCAATGTGCAAATATAGTAGAGCACTTTGGGTACACCCATTTAAGTGCTGGAGATCTTCTTCGTGCAGAAATAAAATCCGGATCCAAAAATGGGACAATGATCCAGAACATGATTTCAGAAGGAATAATTGTTCCTTCAGGAGTAACTAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

205 aa · TkA08G278080|TK1151|PROTEIN

MGTVVDSANKEGTKSVLSVKKPRVVFVLGGPGSGKGTQCANIVEHFGYTHLSAGDLLRAEIKSGSKNGTMIQNMISEGIIVPSGVTIKLLEKAIMEIDNDKFLIDGFPRNEENRAAFELVTGIVPEFVLFFDCSEEEMEKRLLSRNQGRVDDNIETIRKRFKVFVESSLAVIEYYSSKGKVKKIDAGKPVGEVFEEVKAAFAPTK

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G278080
TK1151 IDTkA08G278080
OH-1004 IDLXL04_010621
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)84.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.024 / OH-1004 92.694
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G278080
位置Chr08:72305494-72308168 (+)
描述Similar to UMK3: UMP-CMP kinase 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g26667 催化嘧啶核苷一磷酸的磷酸化，消耗ATP。 暂无已核实直接文献
At3g60180 催化嘧啶核苷一磷酸的磷酸化，消耗ATP。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0778400 催化嘧啶核苷一磷酸的磷酸化，消耗ATP。 暂无已核实直接文献
Os07g0624700 催化嘧啶核苷一磷酸的磷酸化，消耗ATP。 暂无已核实直接文献
Os06g0109600 催化嘧啶核苷一磷酸的磷酸化，消耗ATP。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010621 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006207 'de novo' pyrimidine nucleobase biosynthetic process 生物过程
GO:0006221 pyrimidine nucleotide biosynthetic process 生物过程
GO:0006225 UDP biosynthetic process 生物过程
GO:0009173 pyrimidine ribonucleoside monophosphate metabolic process 生物过程
GO:0046705 CDP biosynthetic process 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0033862 UMP kinase activity 分子功能
GO:0036430 CMP kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G60180
ath:AT5G26667
dosa:Os02g0778400
dosa:Os06g0109600
dosa:Os07g0624700
osa:4339882
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.650
排名 1 · TkA08G278080 · TK1151
细胞核0.297
排名 2 · TkA08G278080 · TK1151
线粒体0.126
排名 3 · TkA08G278080 · TK1151
细胞膜0.105
排名 4 · TkA08G278080 · TK1151
内质网0.068
排名 5 · TkA08G278080 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF24883NPHP3_N11-46 aa
PF06414Zeta_toxin13-40 aa
PF13245AAA_1919-50 aa
PF20720nSTAND319-45 aa
PF18751Ploopntkinase323-55 aa
PF13671AAA_3324-159 aa
PF13238AAA_1825-153 aa
PF00406ADK27-179 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G278080PF24883NPHP3_N11460.2112.5
TkA08G278080PF06414Zeta_toxin13400.01615.4
TkA08G278080PF13245AAA_1919500.00717.3
TkA08G278080PF20720nSTAND319450.2311.9
TkA08G278080PF18751Ploopntkinase323550.1812.1
TkA08G278080PF13671AAA_33241592.1e-0525.6
TkA08G278080PF13238AAA_18251531.6e-0732.6
TkA08G278080PF00406ADK271791.2e-44152.9
TkA08G278080PF13207AAA_17281581e-34120.5
TkA08G278080PF02223Thymidylate_kin30751.4e-0525.6
TkA08G278080PF29468AIM36_C551840.07714.0
TkA08G278080PF02223Thymidylate_kin1221961.4e-0525.6
TkA08G278080PF20720nSTAND31371590.2311.9
TkA08G278080PF22215MLKL_N1421980.2311.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O04905拟南芥sp|O04905|KCY3_ARATH UMP-CMP kinase 378.300%Swiss-Prot高置信
Q8VY84拟南芥sp|Q8VY84|KCY1_ARATH Probable UMP-CMP kinase 168.300%Swiss-Prot高置信
Q6K7H2水稻sp|Q6K7H2|KCY4_ORYSJ UMP-CMP kinase 477.400%Swiss-Prot高置信
Q7XI40水稻sp|Q7XI40|KCY3_ORYSJ UMP-CMP kinase 378.500%Swiss-Prot高置信
Q5VRN0水稻sp|Q5VRN0|KCY1_ORYSJ UMP-CMP kinase 162.800%Swiss-Prot高置信

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