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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G060750
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 16087276-16090742 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1328 bp · TkA07G060750|TK1151|cDNA

TAGAACATTATCAGCCTGATACAAATTTTGGCAAATTTTGTTGAGAGAGACAGAGAGAGCTACCAGTAAGCAGCATCATGGACGCTCTAAGGAAGCAAGCAAGTAAGCTTAGAGATCAAGTTGCCAAACAACAACAGGCTGTGATTAAGCAATTCAGTGCAAGTGGCTATGAACATTCAGATGTGGTGGTTATTGATGAGATGGAGATGCAAAGACACCAGCAGTTAGAGAAGCTCTACAGATCAACTCGTTCAGGAAAG...

CDS

下载 CDS FASTA

1050 bp · TkA07G060750|TK1151|CDS

ATGGACGCTCTAAGGAAGCAAGCAAGTAAGCTTAGAGATCAAGTTGCCAAACAACAACAGGCTGTGATTAAGCAATTCAGTGCAAGTGGCTATGAACATTCAGATGTGGTGGTTATTGATGAGATGGAGATGCAAAGACACCAGCAGTTAGAGAAGCTCTACAGATCAACTCGTTCAGGAAAGGAATTTCAAAGAGAACTGGTTAAAGCAGCAGAAGCTTTTACATCCATAGGATACAAGCATATAGAAGCAGGCACCAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

349 aa · TkA07G060750|TK1151|PROTEIN

MDALRKQASKLRDQVAKQQQAVIKQFSASGYEHSDVVVIDEMEMQRHQQLEKLYRSTRSGKEFQRELVKAAEAFTSIGYKHIEAGTKLSEDCYKYGLENANDEILAKATSIYGDARKHVEKEQEDFTRLLFTQILEPLRAMISGAPLEDARHLAQRYSKMRQEAETQATEVSRRQARVREAPIPENVTKLHAAEARMQELKANMAVLGKEATAALAAVESQQQRLTFQRLVSMVEGERTYHERVAAILHQIEAEMVSDKQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G060750
TK1151 IDTkA07G060750
OH-1004 IDLXL04_027476
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G060750
位置Chr07:16087276-16090742 (+)
描述Similar to SH3P3: SH3 domain-containing protein 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g18060 可能参与将 DRP2A 招募到辅助蛋白复合体中，并负向调节其 GTP 酶活性。 暂无已核实直接文献
At4g34660 可能调节自噬体的形成或成熟。
A BAR-domain protein SH3P2, which binds to phosphatidylinositol 3-phosphate and ATG8, regulates autophagosome formation in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.118307
SH3 Domain-Containing Protein 2 Plays a Crucial Role at the Step of Membrane Tubulation during Cell Plate Formation.2017 · DOI: 10.1105/tpc.17.00108
At1g31440 脂质结合蛋白与磷脂酸、磷脂酰肌醇-4-磷酸和磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸强烈结合。
Role of SH3 domain-containing proteins in clathrin-mediated vesicle trafficking in Arabidopsis.2001 · DOI: 10.1105/tpc.010279

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027476 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006897 endocytosis 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009920 cell plate formation involved in plant-type cell wall biogenesis 生物过程
GO:0072583 clathrin-dependent endocytosis 生物过程
GO:1903527 positive regulation of membrane tubulation 生物过程
GO:0000421 autophagosome membrane 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005768 endosome 细胞组分
GO:0005770 late endosome 细胞组分
GO:0005776 autophagosome 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G31440
ath:AT4G18060
ath:AT4G34660
hsa:115677
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.670
排名 1 · TkA07G060750 · TK1151
细胞膜0.292
排名 2 · TkA07G060750 · TK1151
细胞核0.172
排名 3 · TkA07G060750 · TK1151
高尔基体0.101
排名 4 · TkA07G060750 · TK1151
溶酶体／液泡0.052
排名 5 · TkA07G060750 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03114BAR2-42 aa
PF30804HelD_N3-65 aa
PF10883DUF26814-25 aa
PF13401AAA_2217-64 aa
PF13207AAA_1719-44 aa
PF17855MCM_lid42-99 aa
PF16746BAR_365-199 aa
PF13207AAA_1771-119 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G060750PF03114BAR2420.007116.7
TkA07G060750PF30804HelD_N3650.4911.5
TkA07G060750PF10883DUF26814250.1113.6
TkA07G060750PF13401AAA_2217641.49.9
TkA07G060750PF13207AAA_1719441.59.8
TkA07G060750PF17855MCM_lid42990.07414.3
TkA07G060750PF16746BAR_3651990.1112.8
TkA07G060750PF13207AAA_17711191.59.8
TkA07G060750PF03114BAR772550.007116.7
TkA07G060750PF13401AAA_221221591.49.9
TkA07G060750PF17855MCM_lid1481970.07414.3
TkA07G060750PF10883DUF26811481830.1113.6
TkA07G060750PF30804HelD_N1522400.4911.5
TkA07G060750PF13207AAA_171602051.59.8
TkA07G060750PF10883DUF26812122130.1113.6
TkA07G060750PF13401AAA_222272521.49.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8L7W0拟南芥sp|Q8L7W0|SH3P3_ARATH SH3 domain-containing protein 375.100%Swiss-Prot高置信
Q8VWF1拟南芥sp|Q8VWF1|SH3P2_ARATH SH3 domain-containing protein 253.400%Swiss-Prot高置信
Q9C865拟南芥sp|Q9C865|SH3P1_ARATH SH3 domain-containing protein 144.700%Swiss-Prot中等置信

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