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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G000860
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 232754-238619 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3728 bp · TkA07G000860|TK1151|cDNA

TTTCATAAATTTTGAATCACACACTGGACACTTCCTTCCCCCGCTCTCCCTCCTGAAGCTGAAAAGCATCAGAAAAAGCACCTGTCTTGCTCTTCTTTTTATCATTTTCACCTTTTTCTCCCTCCCTTGGAAATATAATTTTGTGTCTTTCATTGGGTTCTTCTCTTTTCATCTGCAAATTCTCAGAACCGAATCTTTATTCACTCATGTTCTTCAAACCCCATTAGATCAAGCTTCGTTCAAACATAAGCACACACACA...

CDS

下载 CDS FASTA

1617 bp · TkA07G000860|TK1151|CDS

ATGTCTGAAACTCCAGCGGAAGTTTGCTTGGTTCGTTGCCCTAAGTGTGAAAGTCTGCTGCCGGAAGTCACCGATTACCCTGTTTATCAGTGCGGTGGTTGTGGCGCCGTTCTTCGTGCAAATCGTAAACCAATCGAATCCCCAACAGTTTCCAATGAAGAAATCGTCGGTGTTTCAAACAATAATTCTGAAGAATTACAAAATATCAATTTCTTGAATCAGAAAACTAAGAATTCAAGTTCAGAGTTTGATCAAGATGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

538 aa · TkA07G000860|TK1151|PROTEIN

MSETPAEVCLVRCPKCESLLPEVTDYPVYQCGGCGAVLRANRKPIESPTVSNEEIVGVSNNNSEELQNINFLNQKTKNSSSEFDQDDLTCNENMRIDQKLESLKINQESQLEAEDDRVEILLKLDEIKDQIVRSKQKSSFFNNSLRSQAPIQAPYHPQFHHHLCCCLICYNNRHHPLPPPPPPPPPPPPPFHYPHDYNAPRLSTLQKPHTHWSGSLHRPRRGILATTGRRRCRLVAGGSPFLACPSCSQLLQMPTKNTKK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G000860
TK1151 IDTkA07G000860
OH-1004 IDLXL04_026672
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G000860
位置Chr07:232754-238619 (+)
描述Similar to XLG1: Extra-large guanine nucleotide-binding protein 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g23460 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白（G蛋白）作为各种跨膜信号系统中的调节因子或转导子参与其中（通过相似性）。
Arabidopsis extra-large G proteins (XLGs) regulate root morphogenesis.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03335.x
At4g34390 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白（G蛋白）作为各种跨膜信号系统中的调节因子或转导子参与其中（通过相似性）。
Arabidopsis extra-large G proteins (XLGs) regulate root morphogenesis.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03335.x
Arabidopsis extra large G-protein 2 (XLG2) interacts with the Gbeta subunit of heterotrimeric G protein and functions in disease resistance.2009 · DOI: 10.1093/mp/ssp001
Ca2+-dependent GTPase, extra-large G protein 2 (XLG2), promotes activation of DNA-binding protein related to vernalization 1 (RTV1), leading to activation of floral integrator genes and early flowering in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1074/jbc.m111.317412
At1g31930 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白（G蛋白）作为各种跨膜信号系统中的调节因子或转导子参与其中（通过相似性）。
Arabidopsis extra-large G proteins (XLGs) regulate root morphogenesis.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03335.x
Regulation of root-wave response by extra large and conventional G proteins in Arabidopsis thaliana.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03506.x
At5g05190 在水杨酸 (SA) 介导的对白粉病抗性中起负调控作用。
ENHANCED DISEASE RESISTANCE4 associates with CLATHRIN HEAVY CHAIN2 and modulates plant immunity by regulating relocation of EDR1 in Arabidopsis.2015 · DOI: 10.1105/tpc.114.134668

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026672 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006897 endocytosis 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0007188 adenylate cyclase-modulating G protein-coupled receptor signaling pathway 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0009620 response to fungus 生物过程
GO:0009723 response to ethylene 生物过程
GO:0009863 salicylic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0030100 regulation of endocytosis 生物过程
GO:0034052 positive regulation of plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:1900150 regulation of defense response to fungus 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G31930
ath:AT2G23460
ath:AT4G34390
ath:AT5G05190
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.404
排名 1 · TkA07G000860 · TK1151
细胞核0.394
排名 2 · TkA07G000860 · TK1151
细胞膜0.336
排名 3 · TkA07G000860 · TK1151
内质网0.064
排名 4 · TkA07G000860 · TK1151
质体0.044
排名 5 · TkA07G000860 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF22910EDR4-like_1st7-40 aa
PF18608XAF1_C10-21 aa
PF23548Zn_ribbon_FGT1_211-20 aa
PF12760Zn_ribbon_IS159511-36 aa
PF14431YwqJ-deaminase11-23 aa
PF17848Zn_ribbon_ACC11-20 aa
PF13719Zn_ribbon_511-18 aa
PF02150Zn_ribbon_RPB913-37 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G000860PF22910EDR4-like_1st7401.7e-1969.8
TkA07G000860PF18608XAF1_C10210.3511.2
TkA07G000860PF23548Zn_ribbon_FGT1_211200.03214.6
TkA07G000860PF12760Zn_ribbon_IS159511360.04314.5
TkA07G000860PF14431YwqJ-deaminase11230.3411.8
TkA07G000860PF17848Zn_ribbon_ACC11200.5711.2
TkA07G000860PF13719Zn_ribbon_511180.9210.0
TkA07G000860PF02150Zn_ribbon_RPB913371.39.7
TkA07G000860PF11331Zn_ribbon_1229399.4e-1142.0
TkA07G000860PF17848Zn_ribbon_ACC30380.5711.2
TkA07G000860PF13719Zn_ribbon_530380.9210.0
TkA07G000860PF23548Zn_ribbon_FGT1_231380.03214.6
TkA07G000860PF05308Mito_fiss_reg1301920.07214.0
TkA07G000860PF11162DUF29461491983.88.9
TkA07G000860PF16101PRIMA11751902.78.4
TkA07G000860PF11331Zn_ribbon_122362749.4e-1142.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O80462拟南芥sp|O80462|XLG1_ARATH Extra-large guanine nucleotide-binding protein 134.400%Swiss-Prot低置信
C6KIE6拟南芥sp|C6KIE6|XLG2_ARATH Extra-large guanine nucleotide-binding protein 232.700%Swiss-Prot低置信
Q9C516拟南芥sp|Q9C516|XLG3_ARATH Extra-large guanine nucleotide-binding protein 331.500%Swiss-Prot低置信
Q9FHK4拟南芥sp|Q9FHK4|EDR4_ARATH Protein ENHANCED DISEASE RESISTANCE 448.200%Swiss-Prot低置信

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