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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G336390
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 83674921-83677199 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

525 bp · TkA06G336390|TK1151|cDNA

ATGCTTGCACGCCTTCACTGGGATTCTTGGTTCTTTCTCGATTGGAGAGGGAAGCAGCGAAGCAGCAACAGGGGCCGATTTGTGCTCACTGTGAAGAACGTCGAAGTTAGTGCATACTCATCATTTGCAAGAATTGGAGGTGGACTTTATGAGCAACAAAAGAGGAGAGTTGACTCTTCAACAAATCTGTGGGTTACAGATGTTGGCATATCACATCTGGTAAAGAACTGCAAGCATATTGTTGAGTTGAACTTAAGTGG...

CDS

下载 CDS FASTA

525 bp · TkA06G336390|TK1151|CDS

ATGCTTGCACGCCTTCACTGGGATTCTTGGTTCTTTCTCGATTGGAGAGGGAAGCAGCGAAGCAGCAACAGGGGCCGATTTGTGCTCACTGTGAAGAACGTCGAAGTTAGTGCATACTCATCATTTGCAAGAATTGGAGGTGGACTTTATGAGCAACAAAAGAGGAGAGTTGACTCTTCAACAAATCTGTGGGTTACAGATGTTGGCATATCACATCTGGTAAAGAACTGCAAGCATATTGTTGAGTTGAACTTAAGTGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

174 aa · TkA06G336390|TK1151|PROTEIN

MLARLHWDSWFFLDWRGKQRSSNRGRFVLTVKNVEVSAYSSFARIGGGLYEQQKRRVDSSTNLWVTDVGISHLVKNCKHIVELNLSGCKCLELLDITRCIKITDGSLQHIMTKCSGLKSLNLYALSSFTDEAYKKLSLLGNLRFLDLCGAQNLSDEGLLSIAKCKNIRTLSLTW

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G336390
TK1151 IDTkA06G336390
OH-1004 IDLXL04_000289
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)67.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G336390
位置Chr06:83674921-83677199 (+)
描述Similar to At3g58530: F-box protein At3g58530
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g58530 F-box蛋白At3g58530。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000289 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010311 lateral root formation 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0031146 SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0051781 positive regulation of cell division 生物过程
GO:0071365 cellular response to auxin stimulus 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0019005 SCF ubiquitin ligase complex 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G21410
ath:AT3G58530
bta:531211
hsa:144699
mmu:101358
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.400
排名 1 · TkA06G336390 · TK1151
细胞质0.262
排名 2 · TkA06G336390 · TK1151
线粒体0.225
排名 3 · TkA06G336390 · TK1151
质体0.037
排名 4 · TkA06G336390 · TK1151
细胞膜0.037
排名 5 · TkA06G336390 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF25372LRR_FBXL1555-87 aa
PF29594LRR_SKP262-89 aa
PF13516LRR_665-71 aa
PF12799LRR_466-93 aa
PF23286LRR_1368-110 aa
PF29477COS111_C70-87 aa
PF19729LRR_FBXL1875-124 aa
PF23952LRR_EndoS75-126 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G336390PF25372LRR_FBXL1555879.1e-0831.6
TkA06G336390PF29594LRR_SKP262895.6e-0833.1
TkA06G336390PF13516LRR_665710.007317.0
TkA06G336390PF12799LRR_466931.7e-0525.6
TkA06G336390PF23286LRR_13681101.29.5
TkA06G336390PF29477COS111_C70870.311.5
TkA06G336390PF19729LRR_FBXL18751240.3110.1
TkA06G336390PF23952LRR_EndoS751260.3511.8
TkA06G336390PF13516LRR_676890.007317.0
TkA06G336390PF25372LRR_FBXL15831229.1e-0831.6
TkA06G336390PF25013LRR_Zer-1851510.004717.8
TkA06G336390PF13516LRR_6881060.007317.0
TkA06G336390PF12799LRR_4911231.7e-0525.6
TkA06G336390PF29594LRR_SKP2921745.6e-0833.1
TkA06G336390PF29477COS111_C1051300.311.5
TkA06G336390PF13516LRR_61171220.007317.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8LB33拟南芥sp|Q8LB33|FB330_ARATH F-box protein At3g5853066.700%Swiss-Prot低置信

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