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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G021490
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 5869436-5873065 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3198 bp · TkA06G021490|TK1151|cDNA

ATGGCAAAGGGCAAGATAAGAGCCAAGCTGCGGCGGAGCAGCCTCTACACATTAGCCAACATCCGTTCAAAACCATCTTATAAGAAAGAAGAAGCTGCCGGAGACTTGTCTGGATACCCACGCGTCATTCCCGTCAACCAACCTCCCATCGGAGAAGAGGCCCCAATTTTCTGCTCAAACTACGTCTCCACCACCAAATACACATTCTTCAACTTCCTCCCAATCGCCCTCTTTGAACAATTCAACCGCGTCGCTAATTT...

CDS

下载 CDS FASTA

3198 bp · TkA06G021490|TK1151|CDS

ATGGCAAAGGGCAAGATAAGAGCCAAGCTGCGGCGGAGCAGCCTCTACACATTAGCCAACATCCGTTCAAAACCATCTTATAAGAAAGAAGAAGCTGCCGGAGACTTGTCTGGATACCCACGCGTCATTCCCGTCAACCAACCTCCCATCGGAGAAGAGGCCCCAATTTTCTGCTCAAACTACGTCTCCACCACCAAATACACATTCTTCAACTTCCTCCCAATCGCCCTCTTTGAACAATTCAACCGCGTCGCTAATTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1065 aa · TkA06G021490|TK1151|PROTEIN

MAKGKIRAKLRRSSLYTLANIRSKPSYKKEEAAGDLSGYPRVIPVNQPPIGEEAPIFCSNYVSTTKYTFFNFLPIALFEQFNRVANFYFLVAAGLTFTDYAPFDWPSQVVPLALVVGFSLAKEMFEDLQRYWQDKAANRRSTAVHVGNGVFQTKQWNEVCVGDIVKVKKEEFFPADLLLLQSSYEDGMSYVETMNLDGETNLKVKRALQNLNLPVVTEEGASHFEGFRPMIRCENPNPNLYTFMGNLEYDGRIYPLDPAQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G021490
TK1151 IDTkA06G021490
OH-1004 IDLXL04_026206
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)87.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G021490
位置Chr06:5869436-5873065 (-)
描述Similar to ALA4: Probable phospholipid-transporting ATPase 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g17500 参与磷脂的运输。 暂无已核实直接文献
At3g13900 参与磷脂运输及花粉质膜脂质不对称性的调控。
Loss of the Arabidopsis thaliana P4-ATPases ALA6 and ALA7 impairs pollen fitness and alters the pollen tube plasma membrane.2015 · DOI: 10.3389/fpls.2015.00197
At1g72700 参与磷脂的运输。 暂无已核实直接文献
At1g54280 参与磷脂运输及花粉质膜脂质不对称性的调控。
Loss of the Arabidopsis thaliana P4-ATPases ALA6 and ALA7 impairs pollen fitness and alters the pollen tube plasma membrane.2015 · DOI: 10.3389/fpls.2015.00197
At1g68710 参与磷脂的运输。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026206 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009860 pollen tube growth 生物过程
GO:0010286 heat acclimation 生物过程
GO:0045332 phospholipid translocation 生物过程
GO:1901703 protein localization involved in auxin polar transport 生物过程
GO:1905038 regulation of membrane lipid metabolic process 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0012505 endomembrane system 细胞组分
GO:0000287 magnesium ion binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G17500
ath:AT1G54280
ath:AT1G68710
ath:AT1G72700
ath:AT3G13900
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.381
排名 1 · TkA06G021490 · TK1151
内质网0.339
排名 2 · TkA06G021490 · TK1151
高尔基体0.248
排名 3 · TkA06G021490 · TK1151
细胞质0.211
排名 4 · TkA06G021490 · TK1151
溶酶体／液泡0.097
排名 5 · TkA06G021490 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16209PhoLip_ATPase_N46-104 aa
PF00122E1-E2_ATPase141-205 aa
PF00702Hydrolase325-340 aa
PF16212PhoLip_ATPase_C412-430 aa
PF13246Cation_ATPase430-624 aa
PF00702Hydrolase590-651 aa
PF00702Hydrolase733-783 aa
PF14336GLUCM-like_C755-805 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G021490PF16209PhoLip_ATPase_N461045.2e-1968.4
TkA06G021490PF00122E1-E2_ATPase1412057.6e-0523.2
TkA06G021490PF00702Hydrolase3253407.5e-0833.7
TkA06G021490PF16212PhoLip_ATPase_C4124307.9e-62210.0
TkA06G021490PF13246Cation_ATPase4306243.1e-2073.5
TkA06G021490PF00702Hydrolase5906517.5e-0833.7
TkA06G021490PF00702Hydrolase7337837.5e-0833.7
TkA06G021490PF14336GLUCM-like_C7558050.1112.4
TkA06G021490PF08282Hydrolase_37657870.1212.9
TkA06G021490PF16212PhoLip_ATPase_C7978937.9e-62210.0
TkA06G021490PF16212PhoLip_ATPase_C89410017.9e-62210.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LNQ4拟南芥sp|Q9LNQ4|ALA4_ARATH Probable phospholipid-transporting ATPase 455.200%Swiss-Prot高置信
Q9LVK9拟南芥sp|Q9LVK9|ALA7_ARATH Probable phospholipid-transporting ATPase 755.000%Swiss-Prot高置信
Q9SGG3拟南芥sp|Q9SGG3|ALA5_ARATH Probable phospholipid-transporting ATPase 554.300%Swiss-Prot高置信
Q9SLK6拟南芥sp|Q9SLK6|ALA6_ARATH Phospholipid-transporting ATPase 655.000%Swiss-Prot高置信
Q9SX33拟南芥sp|Q9SX33|ALA9_ARATH Putative phospholipid-transporting ATPase 946.100%Swiss-Prot中等置信

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