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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G347990
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 86226851-86229468 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2490 bp · TkA05G347990|TK1151|cDNA

CAAAAAACTACACCAAGAAGAAAGCTTTTGCCTACCCCACTTTGCTCCAAAGAAAATCTCACAAGCCACAAGAACTTGTGGCTCACAATTTTCTACCATTGCGGACGTGTCATACCCTCGCCTCACCTTTTTAATCATCACTACTACTGCCGCGAATTTCAGATTAAAAGCTTTACATTTACAGACGACGACAAACCAAAGACCCTCCGAAAAGAACAAATCTGAATGTCGGAACTTAAAGATTCCGCGATTAAGCTTTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1203 bp · TkA05G347990|TK1151|CDS

ATGAGTTTTACGAAATTTCACGATCAACCTTTTTCTCAGGGTTTCAAAAGGAAACTTGGGTCGTTGTTACTTTTCAAAAAAATAATGGAGGAAGAACACACTACAACTCAAACAGAGGACACATGTTCCAATCCTTCAACATTATCGGGAAACAACGATGATCCAAAAACACCAACCGCCGACAATGAAATTTCATCAAAAAACCCCACCAAAAAAGAAAATCCGGCAACAAATTCAAATTCAAATTCAGAAGAAAAACC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

400 aa · TkA05G347990|TK1151|PROTEIN

MSFTKFHDQPFSQGFKRKLGSLLLFKKIMEEEHTTTQTEDTCSNPSTLSGNNDDPKTPTADNEISSKNPTKKENPATNSNSNSEEKPQKPDKILPCPRCNSMDTKFCYYNNYNVNQPRHFCKNCQRYWTAGGTMRNTPVGSGRRKNKSSSSTSYYRHLFVSEAFQPSWKSNGGVLNFGSNPLCESMNSALNFSDKSRKSEEDHSSSSVQKMNFQKYPCQIQCFPSPSPPHWPYPWNFQEIPKVPLPNTAQHRPPTANLSG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G347990
TK1151 IDTkA05G347990
OH-1004 IDLXL04_021057
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 93.750 / OH-1004 90.385
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G347990
位置Chr05:86226851-86229468 (+)
描述Similar to CDF2: Cyclic dof factor 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g39660 转录因子，能够特异性结合5'-AA[AG]G-3'共识核心序列（通过相似性推测）。
Arabidopsis DOF transcription factors act redundantly to reduce CONSTANS expression and are essential for a photoperiodic flowering response.2009 · DOI: 10.1016/j.devcel.2009.06.015
At5g62430 能特异性结合5'-AA[AG]G-3'共识核心序列的转录因子。 暂无已核实直接文献
At1g69570 转录因子，能够特异性结合5'-AA[AG]G-3'共识核心序列（通过相似性推测）。 暂无已核实直接文献
At3g47500 转录因子，能够特异性结合5'-AA[AG]G-3'共识核心序列（通过相似性推测）。 暂无已核实直接文献
At1g26790 能特异性结合5'-AA[AG]G-3'共识核心序列的转录因子。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021057 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009658 chloroplast organization 生物过程
GO:0009908 flower development 生物过程
GO:0010228 vegetative to reproductive phase transition of meristem 生物过程
GO:0045892 negative regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0048510 regulation of timing of transition from vegetative to reproductive phase 生物过程
GO:0048577 negative regulation of short-day photoperiodism, flowering 生物过程
GO:0048579 negative regulation of long-day photoperiodism, flowering 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0000978 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G69570
ath:AT3G47500
ath:AT5G39660
ath:AT5G62430
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.954
排名 1 · TkA05G347990 · TK1151
细胞质0.120
排名 2 · TkA05G347990 · TK1151
细胞膜0.031
排名 3 · TkA05G347990 · TK1151
内质网0.017
排名 4 · TkA05G347990 · TK1151
线粒体0.012
排名 5 · TkA05G347990 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF26757DUF825081-126 aa
PF23451Zn_ribbon_PaaD82-125 aa
PF02701Zn_ribbon_Dof92-148 aa
PF02701Zn_ribbon_Dof181-189 aa
PF23451Zn_ribbon_PaaD181-188 aa
PF00419Fimbrial333-389 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G347990PF26757DUF8250811260.3511.8
TkA05G347990PF23451Zn_ribbon_PaaD821250.4311.0
TkA05G347990PF02701Zn_ribbon_Dof921487.3e-32110.0
TkA05G347990PF02701Zn_ribbon_Dof1811897.3e-32110.0
TkA05G347990PF23451Zn_ribbon_PaaD1811880.4311.0
TkA05G347990PF00419Fimbrial3333890.02515.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q93ZL5拟南芥sp|Q93ZL5|CDF2_ARATH Cyclic dof factor 241.000%Swiss-Prot中等置信
Q8W1E3拟南芥sp|Q8W1E3|CDF1_ARATH Cyclic dof factor 141.400%Swiss-Prot中等置信
Q9SEZ3拟南芥sp|Q9SEZ3|CDF5_ARATH Cyclic dof factor 538.600%Swiss-Prot中等置信
Q8LFV3拟南芥sp|Q8LFV3|CDF3_ARATH Cyclic dof factor 336.900%Swiss-Prot中等置信
Q9LQX4拟南芥sp|Q9LQX4|DOF13_ARATH Dof zinc finger protein DOF1.338.500%Swiss-Prot中等置信

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