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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G157940
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 40862975-40863847 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

780 bp · TkA04G157940|TK1151|cDNA

ATGGAAGATGCTCTTTGTATAGAAAAACAGTTCGTAGGTGACGAAAACTCAATAAAGTTTGATTTTTATGGTGTTTACGATGGCCATGGTGGCTCCCGTGTTGCGTACGCATGTCGTGAGCGGTTACATAAGTTACTGGCGGCGGAAATGAACATTCAAAATAGAAGCACGACGGCGGAGATGAACTGGGAAAATTTGATGGTGGAGAGCTTCACGAAAATGGATGAGGAAGTGAATGAAACTGATGTCGTGGATTCCAT...

CDS

下载 CDS FASTA

780 bp · TkA04G157940|TK1151|CDS

ATGGAAGATGCTCTTTGTATAGAAAAACAGTTCGTAGGTGACGAAAACTCAATAAAGTTTGATTTTTATGGTGTTTACGATGGCCATGGTGGCTCCCGTGTTGCGTACGCATGTCGTGAGCGGTTACATAAGTTACTGGCGGCGGAAATGAACATTCAAAATAGAAGCACGACGGCGGAGATGAACTGGGAAAATTTGATGGTGGAGAGCTTCACGAAAATGGATGAGGAAGTGAATGAAACTGATGTCGTGGATTCCAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

259 aa · TkA04G157940|TK1151|PROTEIN

MEDALCIEKQFVGDENSIKFDFYGVYDGHGGSRVAYACRERLHKLLAAEMNIQNRSTTAEMNWENLMVESFTKMDEEVNETDVVDSMGSTAVVAVVGDKEIVVANCGDSRAVLSRGGFSVPLSVDHKPDRPDELERIECSGGRVIDWNGLRVLGVLATSRAIGDRQLKPYVIPKPEVTVNKREDADEFMILASDGLWDVISNDLACQVVRKCLDGWTCRRRSLKENHVRTNNAAVFLTELAMARGSKDNISVIVVNLKH

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G157940
TK1151 IDTkA04G157940
OH-1004 IDLXL04_035180
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 77.313
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G157940
位置Chr04:40862975-40863847 (-)
描述Similar to Os01g0656200: Probable protein phosphatase 2C 8
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g11410 种子萌发和冷驯化过程中脱落酸 反应的主要负调节因子。
Antisense inhibition of protein phosphatase 2C accelerates cold acclimation in Arabidopsis thaliana.2001 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2001.01048.x
Physical and functional interaction of the Arabidopsis K(+) channel AKT2 and phosphatase AtPP2CA.2002 · DOI: 10.1105/tpc.000943
ABA-hypersensitive germination3 encodes a protein phosphatase 2C (AtPP2CA) that strongly regulates abscisic acid signaling during germination among Arabidopsis protein phosphatase 2Cs.2006 · DOI: 10.1104/pp.105.070128
The protein phosphatase AtPP2CA negatively regulates abscisic acid signal transduction in Arabidopsis, and effects of abh1 on AtPP2CA mRNA.2006 · DOI: 10.1104/pp.105.070318
ABA-Hypersensitive Germination1 encodes a protein phosphatase 2C, an essential component of abscisic acid signaling in Arabidopsis seed.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03107.x
ABI1 and PP2CA phosphatases are negative regulators of Snf1-related protein kinase1 signaling in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.114066
At2g29380 可能的蛋白质磷酸酶 2C 24。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0656200 可能的蛋白磷酸酶2C 8。 暂无已核实直接文献
Os05g0572700 蛋白磷酸酶，作为种子萌发的正调控因子。
The protein phosphatase 2C clade A protein OsPP2C51 positively regulates seed germination by directly inactivating OsbZIP10.2017 · DOI: 10.1007/s11103-016-0568-2
Os09g0325700 参与非生物胁迫反应的调控。
A novel nuclear protein phosphatase 2C negatively regulated by ABL1 is involved in abiotic stress and panicle development in rice.2013 · DOI: 10.1007/s12033-012-9614-8
ABA inducible rice protein phosphatase 2C confers ABA insensitivity and abiotic stress tolerance in Arabidopsis.2015 · DOI: 10.1371/journal.pone.0125168
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_035180 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009788 negative regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010030 positive regulation of seed germination 生物过程
GO:1902531 regulation of intracellular signal transduction 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004722 protein serine/threonine phosphatase activity 分子功能
GO:0046872 metal ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G29380
dosa:Os01g0656200
dosa:Os01g0846300
dosa:Os05g0572700
dosa:Os09g0325700
osa:4346736
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.529
排名 1 · TkA04G157940 · TK1151
细胞核0.510
排名 2 · TkA04G157940 · TK1151
细胞膜0.097
排名 3 · TkA04G157940 · TK1151
溶酶体／液泡0.052
排名 4 · TkA04G157940 · TK1151
内质网0.051
排名 5 · TkA04G157940 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00481PP2C1-250 aa
PF13672PP2C_229-124 aa
PF13672PP2C_2184-200 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G157940PF00481PP2C12502.4e-66224.7
TkA04G157940PF13672PP2C_2291240.0002521.4
TkA04G157940PF13672PP2C_21842000.0002521.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P49598拟南芥sp|P49598|P2C37_ARATH Protein phosphatase 2C 3752.300%Swiss-Prot高置信
Q9ZW21拟南芥sp|Q9ZW21|P2C24_ARATH Probable protein phosphatase 2C 2452.700%Swiss-Prot高置信
Q5SN75水稻sp|Q5SN75|P2C08_ORYSJ Probable protein phosphatase 2C 856.100%Swiss-Prot高置信
Q65XK7水稻sp|Q65XK7|P2C51_ORYSJ Protein phosphatase 2C 5153.000%Swiss-Prot高置信
Q0J2L7水稻sp|Q0J2L7|P2C68_ORYSJ Probable protein phosphatase 2C 6854.300%Swiss-Prot高置信

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