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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G119340
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 31025624-31027392 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1510 bp · TkA04G119340|TK1151|cDNA

CCAAGGTCGGTTAGGGCAGCGTATAAATTGAGTTCCAGAAGGTTATGGCCGCCATTAATTATAACCACGGTTTCTTCTGCTAAACGAAACAAGCGAAAAGTAGCGAAAATGGAGAACGGCAACCACAAAGAAGTCCCCGACAACGCCAATGAACATTGCCCAGGAACAGAAGCAGAAGATGCCGGAAAATCTGATGCTTGCGCAGGTTGCCCTAATCAAGAAGCTTGTGCTACTGCTCCCAAAGGCCCCGATCCAGATTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1161 bp · TkA04G119340|TK1151|CDS

CCAAGGTCGGTTAGGGCAGCGTATAAATTGAGTTCCAGAAGGTTATGGCCGCCATTAATTATAACCACGGTTTCTTCTGCTAAACGAAACAAGCGAAAAGTAGCGAAAATGGAGAACGGCAACCACAAAGAAGTCCCCGACAACGCCAATGAACATTGCCCAGGAACAGAAGCAGAAGATGCCGGAAAATCTGATGCTTGCGCAGGTTGCCCTAATCAAGAAGCTTGTGCTACTGCTCCCAAAGGCCCCGATCCAGATTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

386 aa · TkA04G119340|TK1151|PROTEIN

PRSVRAAYKLSSRRLWPPLIITTVSSAKRNKRKVAKMENGNHKEVPDNANEHCPGTEAEDAGKSDACAGCPNQEACATAPKGPDPDLVAIAERMATVKHKILILSGKGGVGKSTFSAQLSFALAAMDHQVGLLDIDICGPSIPKMLGLEGQEIHQSNLGWSPVYVDSIGVMSIGFMLPDPDDAVIWRGPRKNGIIKQFLKDVYWGELDFLVVDAPPGTSDEHISIVQFLKETGIDGAIIVTTPQQVSLIDVRKEVSFCKK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G119340
TK1151 IDTkA04G119340
OH-1004 IDLXL04_000975
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)35.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 70.466 / OH-1004 78.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G119340
位置Chr04:31025624-31027392 (-)
描述Similar to nubpl: Iron-sulfur protein NUBPL
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g50960 胞质铁硫（Fe-S）蛋白装配（CIA）机制的组成部分。
The essential cytosolic iron-sulfur protein Nbp35 acts without Cfd1 partner in the green lineage.2008 · DOI: 10.1074/jbc.m807303200
Arabidopsis cytosolic Nbp35 homodimer can assemble both [2Fe-2S] and [4Fe-4S] clusters in two distinct domains.2009 · DOI: 10.1016/j.bbrc.2008.11.138

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000975 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007005 mitochondrion organization 生物过程
GO:0016226 iron-sulfur cluster assembly 生物过程
GO:0032543 mitochondrial translation 生物过程
GO:0032981 mitochondrial respiratory chain complex I assembly 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005743 mitochondrial inner membrane 细胞组分
GO:0005759 mitochondrial matrix 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0046872 metal ion binding 分子功能
GO:0051539 4 iron, 4 sulfur cluster binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G19540
ddi:DDB_G0291193
hsa:80224
mmu:76826
yli:2907193
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.674
排名 1 · TkA04G119340 · TK1151
线粒体0.160
排名 2 · TkA04G119340 · TK1151
细胞质0.151
排名 3 · TkA04G119340 · TK1151
细胞核0.072
排名 4 · TkA04G119340 · TK1151
过氧化物酶体0.061
排名 5 · TkA04G119340 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03308MeaB13-30 aa
PF02367TsaE88-124 aa
PF00931NB-ARC92-120 aa
PF25199nSTAND_NTPase595-134 aa
PF03193RsgA_GTPase95-120 aa
PF10609ParA97-281 aa
PF20720nSTAND398-130 aa
PF13481AAA_2598-125 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G119340PF03308MeaB13300.03513.8
TkA04G119340PF02367TsaE881240.3611.5
TkA04G119340PF00931NB-ARC921200.1112.7
TkA04G119340PF25199nSTAND_NTPase5951340.003717.8
TkA04G119340PF03193RsgA_GTPase951200.02914.9
TkA04G119340PF10609ParA972813.9e-89299.0
TkA04G119340PF20720nSTAND3981300.001918.6
TkA04G119340PF13481AAA_25981250.005917.0
TkA04G119340PF02374ArsA_ATPase991366.1e-0832.9
TkA04G119340PF03308MeaB991380.03513.8
TkA04G119340PF13614AAA_311001372.6e-0628.1
TkA04G119340PF09140MipZ1002150.0001122.4
TkA04G119340PF13500AAA_261001240.005917.2
TkA04G119340PF00448SRP541001370.07513.4
TkA04G119340PF01583APS_kinase1001500.1512.8
TkA04G119340PF01656CbiA1012714.1e-1246.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8H1Q2拟南芥sp|Q8H1Q2|NBP35_ARATH Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NBP3579.200%Swiss-Prot高置信

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