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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G068710
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 18212786-18217665 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

714 bp · TkA04G068710|TK1151|cDNA

ATGGATCTTGCTGTGAGAGGAACTGGAGCGCCGAGCGGGTCGGAGACGGGCGGATCGGACGCGGGCGCGCGGGAGCTGGACGCGGGCGCGCGGATCGGACGCGGGACTGGGCTCCGGCTTTGGGCTTCGCTTTTGGGCTGCTGGCGGATCAGGCGGATTTGGGCTGCGATTGTCGACTGGGCTACGAACTGGGCTCCGGTTTTCTTTAGAGTTGAAACTGGAGTTGAAGAAGGGGACACTGTAAGCATGCATTATGACCC...

CDS

下载 CDS FASTA

714 bp · TkA04G068710|TK1151|CDS

ATGGATCTTGCTGTGAGAGGAACTGGAGCGCCGAGCGGGTCGGAGACGGGCGGATCGGACGCGGGCGCGCGGGAGCTGGACGCGGGCGCGCGGATCGGACGCGGGACTGGGCTCCGGCTTTGGGCTTCGCTTTTGGGCTGCTGGCGGATCAGGCGGATTTGGGCTGCGATTGTCGACTGGGCTACGAACTGGGCTCCGGTTTTCTTTAGAGTTGAAACTGGAGTTGAAGAAGGGGACACTGTAAGCATGCATTATGACCC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

237 aa · TkA04G068710|TK1151|PROTEIN

MDLAVRGTGAPSGSETGGSDAGARELDAGARIGRGTGLRLWASLLGCWRIRRIWAAIVDWATNWAPVFFRVETGVEEGDTVSMHYDPMIAKLVVWGEEGDTVSMHYDPMIAKLVVWGENSACDFIKLNDSLSKFQKVGHGSNENGAVKASSSSTDPITVGQMKILLGFLRSIINNLTPNPKLSAVFKSMNIQMPKTSTGSTSTVNQSSSSKSDQMQGKMTILPFLMFHLSYICYDRL

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G068710
TK1151 IDTkA04G068710
OH-1004 IDLXL04_036168
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)88.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 65.401 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G068710
位置Chr04:18212786-18217665 (-)
描述Similar to MCCA: Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g03090 生物素结合亚基的3-甲基戊二酰辅酶A羧化酶，一种催化3-甲基戊二酰辅酶A转化为3-甲基戊二酰谷氨酰辅酶A的酶，这是亮氨酸和异戊酸分解代谢的关键步骤。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os12g0605800 生物素结合亚基的3-甲基戊二酰辅酶A羧化酶，一种催化3-甲基戊二酰辅酶A转化为3-甲基戊二酰谷氨酰辅酶A的酶，这是亮氨酸和异戊酸分解代谢的关键步骤。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036168 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006552 L-leucine catabolic process 生物过程
GO:0006768 biotin metabolic process 生物过程
GO:0009083 branched-chain amino acid catabolic process 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005759 mitochondrial matrix 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0022626 cytosolic ribosome 细胞组分
GO:1905202 methylcrotonoyl-CoA carboxylase complex 细胞组分
GO:0004075 biotin carboxylase activity 分子功能
GO:0004485 methylcrotonoyl-CoA carboxylase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G03090
dosa:Os12g0605800
hsa:56922
rno:294972
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.362
排名 1 · TkA04G068710 · TK1151
细胞核0.319
排名 2 · TkA04G068710 · TK1151
细胞膜0.166
排名 3 · TkA04G068710 · TK1151
线粒体0.164
排名 4 · TkA04G068710 · TK1151
内质网0.131
排名 5 · TkA04G068710 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02785Biotin_carb_C69-97 aa
PF02785Biotin_carb_C97-138 aa
PF02785Biotin_carb_C139-175 aa
PF02785Biotin_carb_C183-210 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G068710PF02785Biotin_carb_C69972.1e-1763.9
TkA04G068710PF02785Biotin_carb_C971382.1e-1763.9
TkA04G068710PF02785Biotin_carb_C1391752.1e-1763.9
TkA04G068710PF02785Biotin_carb_C1832102.1e-1763.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q42523拟南芥sp|Q42523|MCCA_ARATH Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial47.600%Swiss-Prot低置信
Q2QMG2水稻sp|Q2QMG2|MCCA_ORYSJ Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial53.600%Swiss-Prot低置信

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