TkA03G570130 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA03G570130

当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 144641786-144647024 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

4301 bp · TkA03G570130|TK1151|cDNA

GTTGTTATTAGTTCATGACTTTTTCTATGGCTTTGAAGGTGAAATGTGTTTTTGGTTGGTGATTGTTGAAAGTTCCAACGTTTTCTACTATTCCATACGCAGTCGCAGACATGGCCATGGGCCGTCTACGAAGACCTTTTGAGGTCAAAGGAGTCCTTATTCAAACCTTCTAGTCTGTCTGTCATACGAGTCGCAATTTCCTCACGTTTTCTTATCTTCTTCTTTTTCTTAATTTCCCATTTATATACTTGGTATCTAAT...

CDS

下载 CDS FASTA

3546 bp · TkA03G570130|TK1151|CDS

ATGGCACATGGGAGGAAAAAGAAGGTGCAGCTTAGCAAGATGTACTCATTTAGGAGAGAACGATTCGAAGAGGATCATTCACAGATTGGAGGACCTGGGTTTTCTAGGGTGATTTATTGCAATGAAAATGGTGAATCAGAGGGTATGATTCAAAATTACGCCGATAATTATGTGAGGTTAACAAAGTACACACCGGTGACATTTCTCCCAAAATCATTGTTTGAACAGTTTCGAAGAGTCGCTAATTTCTACTTTCTTGT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

1181 aa · TkA03G570130|TK1151|PROTEIN

MAHGRKKKVQLSKMYSFRRERFEEDHSQIGGPGFSRVIYCNENGESEGMIQNYADNYVRLTKYTPVTFLPKSLFEQFRRVANFYFLVAGLLAFTPLAPYSPVSAILPLIIVIGATMVKEGIEDWQRQQQDHEVNNRKTKVHRRGGVFESSQWKKIKVGDIVKVEKDQFFPADLLLLSSSYEDAICYVETMNLDGETNLKLKQSLDVTSSINEDSKFNNFKATVRCEDPNASLYTFVGTMQFQDQRYALSPQQLLLRDSKL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA03G570130`
TK1151 ID	TkA03G570130
OH-1004 ID	LXL04_011169
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	99.700
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA03G570130

位置 Chr03:144641786-144647024 (+)

描述 Similar to ALA9: Putative phospholipid-transporting ATPase 9

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g68710`	参与磷脂的运输。	暂无已核实直接文献
`At1g13210`	参与磷脂的运输。	暂无已核实直接文献
`At3g25610`	参与磷脂的运输。	暂无已核实直接文献
`At1g26130`	参与磷脂的运输。	暂无已核实直接文献
`At3g27870`	参与磷脂的运输。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011169 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0045332 phospholipid translocation 生物过程

GO:1901703 protein localization involved in auxin polar transport 生物过程

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分

GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分

GO:0000287 magnesium ion binding 分子功能

GO:0005524 ATP binding 分子功能

GO:0016887 ATP hydrolysis activity 分子功能

GO:0090554 phosphatidylcholine floppase activity 分子功能

GO:0140326 ATPase-coupled intramembrane lipid transporter activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G13210

ath:AT1G26130

ath:AT1G68710

ath:AT3G25610

ath:AT3G27870

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.523

排名 1 · TkA03G570130 · TK1151

内质网0.226

排名 2 · TkA03G570130 · TK1151

细胞质0.192

排名 3 · TkA03G570130 · TK1151

高尔基体0.168

排名 4 · TkA03G570130 · TK1151

溶酶体／液泡0.130

排名 5 · TkA03G570130 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16209PhoLip_ATPase_N38-105 aa

PF00122E1-E2_ATPase134-202 aa

PF16209PhoLip_ATPase_N301-308 aa

PF00702Hydrolase418-522 aa

PF13246Cation_ATPase505-702 aa

PF00702Hydrolase652-730 aa

PF03853YjeF_N706-800 aa

PF00702Hydrolase827-867 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA03G570130	`PF16209`	PhoLip_ATPase_N	38	105	1.2e-21	76.9
TkA03G570130	`PF00122`	E1-E2_ATPase	134	202	0.00046	20.6
TkA03G570130	`PF16209`	PhoLip_ATPase_N	301	308	1.2e-21	76.9
TkA03G570130	`PF00702`	Hydrolase	418	522	7e-13	50.1
TkA03G570130	`PF13246`	Cation_ATPase	505	702	1.1e-20	74.9
TkA03G570130	`PF00702`	Hydrolase	652	730	7e-13	50.1
TkA03G570130	`PF03853`	YjeF_N	706	800	0.22	12.1
TkA03G570130	`PF00702`	Hydrolase	827	867	7e-13	50.1
TkA03G570130	`PF08282`	Hydrolase_3	846	871	0.0019	18.7
TkA03G570130	`PF16212`	PhoLip_ATPase_C	881	1131	5.7e-90	302.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9SX33`	拟南芥	sp\|Q9SX33\|ALA9_ARATH Putative phospholipid-transporting ATPase 9	72.200%	Swiss-Prot	高置信
`Q9SAF5`	拟南芥	sp\|Q9SAF5\|ALA11_ARATH Probable phospholipid-transporting ATPase 11	70.400%	Swiss-Prot	高置信
`Q9LI83`	拟南芥	sp\|Q9LI83\|ALA10_ARATH Phospholipid-transporting ATPase 10	71.200%	Swiss-Prot	高置信
`P57792`	拟南芥	sp\|P57792\|ALA12_ARATH Probable phospholipid-transporting ATPase 12	69.400%	Swiss-Prot	高置信
`Q9LK90`	拟南芥	sp\|Q9LK90\|ALA8_ARATH Probable phospholipid-transporting ATPase 8	61.900%	Swiss-Prot	高置信

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