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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G541850
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 136456111-136457528 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1317 bp · TkA03G541850|TK1151|cDNA

ATGTCCCTTAAACTCGGTAGCACGACCATGGTGGTTGTATCATCTCGTGAAATCGCTCAAGAATTCTTTTCAAAACATGACATTTCGTTTTCCAGCCGATCGATCCCGTACGCCGCCCATGCACACGATCGCCATAAAATCTCGATGGTTTGGCTGCCGGTCGGGGACCAATGGCGCGGACTACGAAAACTATCGAAAGAGCATTTGTTTTCTGTACGGCAACTTGACGCGAGTCAGCATTTACGCAAGAAAAAGGTTCA...

CDS

下载 CDS FASTA

1317 bp · TkA03G541850|TK1151|CDS

ATGTCCCTTAAACTCGGTAGCACGACCATGGTGGTTGTATCATCTCGTGAAATCGCTCAAGAATTCTTTTCAAAACATGACATTTCGTTTTCCAGCCGATCGATCCCGTACGCCGCCCATGCACACGATCGCCATAAAATCTCGATGGTTTGGCTGCCGGTCGGGGACCAATGGCGCGGACTACGAAAACTATCGAAAGAGCATTTGTTTTCTGTACGGCAACTTGACGCGAGTCAGCATTTACGCAAGAAAAAGGTTCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

438 aa · TkA03G541850|TK1151|PROTEIN

MSLKLGSTTMVVVSSREIAQEFFSKHDISFSSRSIPYAAHAHDRHKISMVWLPVGDQWRGLRKLSKEHLFSVRQLDASQHLRKKKVQELVDYVEDCCENGKVVNIGQIAATTTLNVLSNFIFSVDLAEYDSVSSQDFKDLVGGLMVVGGTPNLADFFPVLRPFDPQGLLRRADFYTGKLMEIFEEHIGKRLVERTKSSSDHTPPSSKDLTDLMLDMIGEKENCIFTIDDMRNLLFDLFLAGTDTTSSTLEWAMAELIHSP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G541850
TK1151 IDTkA03G541850
OH-1004 IDLXL04_010661
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)98.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 86.905
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G541850
位置Chr03:136456111-136457528 (+)
描述Similar to CYP76T24: Cytochrome P450 76T24
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010661 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0016099 monoterpenoid biosynthetic process 生物过程
GO:0016102 diterpenoid biosynthetic process 生物过程
GO:0016114 terpenoid biosynthetic process 生物过程
GO:1901946 miltiradiene biosynthetic process 生物过程
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0031969 chloroplast membrane 细胞组分
GO:0004497 monooxygenase activity 分子功能
GO:0005506 iron ion binding 分子功能
GO:0016705 oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen 分子功能
GO:0016709 oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, NAD(P)H as one donor, and incorporation of one atom of oxygen 分子功能
GO:0016712 oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, reduced flavin or flavoprotein as one donor, and incorporation of one atom of oxygen 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ag:AGN04215
ag:CAC80883
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.921
排名 1 · TkA03G541850 · TK1151
细胞质0.050
排名 2 · TkA03G541850 · TK1151
细胞膜0.038
排名 3 · TkA03G541850 · TK1151
质体0.027
排名 4 · TkA03G541850 · TK1151
高尔基体0.026
排名 5 · TkA03G541850 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00067p4501-425 aa
PF19960EAD778-94 aa
PF19960EAD7225-258 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G541850PF00067p45014255.8e-92309.6
TkA03G541850PF19960EAD778940.02315.3
TkA03G541850PF19960EAD72252580.02315.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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