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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G372060
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 91787792-91789115 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1232 bp · TkA03G372060|TK1151|cDNA

ATTTACACTTAGCCCCCCTCCTTCTTCACTCCTCAAATACCGCCCACCACCAACACACCTTTCACCTTTCTCCGTTTCTCTCCAATAATCACAAGTTGCATTCATGGGAAGTTACTTCGGCGCCGGAGAATGCTTCTTTGAGCACCAGAAGCCGGTCGAATTCATCAACGGAGGCAATCAGTTCACCATTGATGACTTGCTCCTTGACTTTCCTAACGACGAAGATGTCGTCATGAACGAGGCCTTTTACGAGAGTTTTA...

CDS

下载 CDS FASTA

942 bp · TkA03G372060|TK1151|CDS

ATGGGAAGTTACTTCGGCGCCGGAGAATGCTTCTTTGAGCACCAGAAGCCGGTCGAATTCATCAACGGAGGCAATCAGTTCACCATTGATGACTTGCTCCTTGACTTTCCTAACGACGAAGATGTCGTCATGAACGAGGCCTTTTACGAGAGTTTTAATAATTCTAATTCAGCTGATTTTTCCAGCTCAAATTCCTCTGTCTCCGGCAGCGAAGCTCAGTTATCCGGCAATATCAGCTCCTATAGCCTCTCTGACTCTCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

313 aa · TkA03G372060|TK1151|PROTEIN

MGSYFGAGECFFEHQKPVEFINGGNQFTIDDLLLDFPNDEDVVMNEAFYESFNNSNSADFSSSNSSVSGSEAQLSGNISSYSLSDSQFSGDELCLPYDELAELEWLSSFTEESLSSDDLHNLQLISAANKAPATDTSSSDTTPEFQHKTTGPNRINSPIFQTNVLVPGKVRSKRSRAAPCDWSSRLLLLKSSTTDINKPNSSDNSVRRCLHCGSDKTPQWRRGPMGPKTLCNACGVRFKSGRLVPEYRPAASPSFVPAKH...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G372060
TK1151 IDTkA03G372060
OH-1004 IDLXL04_032144
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)61.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 97.273
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G372060
位置Chr03:91787792-91789115 (-)
描述Similar to GATA9: GATA transcription factor 9
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g25830 转录激活因子，特异性结合基因启动子内的 5'-GATA-3' 或 5'-GAT-3' 基序。 暂无已核实直接文献
At4g32890 转录激活因子，特异性结合基因启动子内的 5'-GATA-3' 或 5'-GAT-3' 基序。 暂无已核实直接文献
At2g45050 转录激活因子，特异性结合基因启动子内的 5'-GATA-3' 或 5'-GAT-3' 基序。 暂无已核实直接文献
At3g60530 转录激活因子，特异性结合基因启动子内的 5'-GATA-3' 或 5'-GAT-3' 基序。 暂无已核实直接文献
At1g08010 转录激活因子，特异性结合基因启动子内的 5'-GATA-3' 或 5'-GAT-3' 基序。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032144 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006357 regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程
GO:0007623 circadian rhythm 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0071555 cell wall organization 生物过程
GO:1905177 tracheary element differentiation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
GO:0008270 zinc ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G45050
ath:AT3G60530
ath:AT4G32890
ath:AT5G25830
ath:AT5G66320
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.964
排名 1 · TkA03G372060 · TK1151
细胞质0.118
排名 2 · TkA03G372060 · TK1151
细胞膜0.036
排名 3 · TkA03G372060 · TK1151
内质网0.029
排名 4 · TkA03G372060 · TK1151
质体0.016
排名 5 · TkA03G372060 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF24444DUF7563207-222 aa
PF00320GATA209-243 aa
PF24444DUF7563231-235 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G372060PF24444DUF75632072222.38.5
TkA03G372060PF00320GATA2092433.8e-1659.1
TkA03G372060PF24444DUF75632312352.38.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P69781拟南芥sp|P69781|GAT12_ARATH GATA transcription factor 1249.800%Swiss-Prot中等置信
O82632拟南芥sp|O82632|GATA9_ARATH GATA transcription factor 941.500%Swiss-Prot中等置信
O49741拟南芥sp|O49741|GATA2_ARATH GATA transcription factor 242.300%Swiss-Prot中等置信
O49743拟南芥sp|O49743|GATA4_ARATH GATA transcription factor 443.700%Swiss-Prot中等置信
Q6DBP8拟南芥sp|Q6DBP8|GAT11_ARATH GATA transcription factor 1160.200%Swiss-Prot低置信

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