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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G025710
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 6647617-6649597 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1776 bp · TkA03G025710|TK1151|cDNA

ATTTATTAGGGTTTTTATTGCCGAGTCCCAAAAAAACAAACCCACATTCAATGCAGAACGCGGTTTTAGGGAGACGATGTACATGATAATGATAATATCGCGACACATACACACACATACACACACAGTGGGGTGGGCTGACTTTAGCTTTAAGCTGCGTACTGCCATAGCTGTGCCAGCATGCATGAGCTTTGAGTAAATGCTCTCTTTGGGTCTTCGCTGTCACCCCACCCCACCCCACTATCCCTTTTGACTCTTTA...

CDS

下载 CDS FASTA

972 bp · TkA03G025710|TK1151|CDS

ATGGGGCGGCCTCCATGTTGTGATAAACTTGGTGTCAAGAAAGGTCCATGGACTCCTGAAGAAGATATCATGCTTGTTTCTTATGTTCAACAACATGGTCCTGGGAATTGGCGCCAAGTCCCTACTAACACTGGACTTAGAAGATGCAGCAAGAGTTGTAGGTTGAGATGGACGAATTATTTAAGGCCGGGAATAAGAAGGGGGGATTTCACCGATGATGAAGAGAAAATGATAATTCAACTTCAAGCTCTTTTGGGTAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

323 aa · TkA03G025710|TK1151|PROTEIN

MGRPPCCDKLGVKKGPWTPEEDIMLVSYVQQHGPGNWRQVPTNTGLRRCSKSCRLRWTNYLRPGIRRGDFTDDEEKMIIQLQALLGNKWAAIASYLPERTDNDIKNYWNTHLKKKLKKLEMGSDNINVNNKDRFSSSTSSSSSSHCVSRGQWEKRLQTDIHMAKQALNDALSIDQKPVFVPQTTKSSSQTPAYPSSTDNIAKLLKGFMKNSAVYTKTCSDSSVHESSGEVNASESKIDLSEAFESLFGFDQSFGSSPNNS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G025710
TK1151 IDTkA03G025710
OH-1004 IDLXL04_006284
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G025710
位置Chr03:6647617-6649597 (+)
描述Similar to MYB30: Transcription factor MYB30
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g28910 特异性结合DNA序列5′-AACAAAC-3′的转录因子。
A novel myb oncogene homologue in Arabidopsis thaliana related to hypersensitive cell death.1999 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.1999.00578.x
A R2R3-MYB gene, AtMYB30, acts as a positive regulator of the hypersensitive cell death program in plants in response to pathogen attack.2002 · DOI: 10.1073/pnas.152047199
An essential role for salicylic acid in AtMYB30-mediated control of the hypersensitive cell death program in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1016/j.febslet.2006.05.027
A MYB transcription factor regulates very-long-chain fatty acid biosynthesis for activation of the hypersensitive cell death response in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1105/tpc.107.054858
Arabidopsis MYB30 is a direct target of BES1 and cooperates with BES1 to regulate brassinosteroid-induced gene expression.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03778.x
AtsPLA2-alpha nuclear relocalization by the Arabidopsis transcription factor AtMYB30 leads to repression of the plant defense response.2010 · DOI: 10.1073/pnas.1009056107
Sumoylation of transcription factor MYB30 by the small ubiquitin-like modifier E3 ligase SIZ1 mediates abscisic acid response in Arabidopsis thaliana.2012 · DOI: 10.1073/pnas.1202630109
Elevated levels of MYB30 in the phloem accelerate flowering in Arabidopsis through the regulation of FLOWERING LOCUS T.2014 · DOI: 10.1371/journal.pone.0089799
At3g47600 转录激活剂参与干旱胁迫下角质层蜡生物合成的激活。
Cuticular wax biosynthesis is up-regulated by the MYB94 transcription factor in Arabidopsis.2015 · DOI: 10.1093/pcp/pcu142
MYB94 and MYB96 Additively Activate Cuticular Wax Biosynthesis in Arabidopsis.2016 · DOI: 10.1093/pcp/pcw147
At5g62470 转录激活剂参与干旱胁迫下角质层蜡生物合成的激活。
The MYB96 transcription factor mediates abscisic acid signaling during drought stress response in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1104/pp.109.144220
MYB96-mediated abscisic acid signals induce pathogen resistance response by promoting salicylic acid biosynthesis in Arabidopsis.2010 · DOI: 10.1111/j.1469-8137.2010.03183.x
The MYB96 transcription factor regulates cuticular wax biosynthesis under drought conditions in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1105/tpc.111.083485
Lipid transfer protein 3 as a target of MYB96 mediates freezing and drought stress in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1093/jxb/ert040
The Arabidopsis MYB96 transcription factor plays a role in seed dormancy.2015 · DOI: 10.1007/s11103-015-0283-4
The Arabidopsis MYB96 Transcription Factor Is a Positive Regulator of ABSCISIC ACID-INSENSITIVE4 in the Control of Seed Germination.2015 · DOI: 10.1104/pp.15.00162
The MYB96-HHP module integrates cold and abscisic acid signaling to activate the CBF-COR pathway in Arabidopsis.2015 · DOI: 10.1111/tpj.12866
MYB96 shapes the circadian gating of ABA signaling in Arabidopsis.2016 · DOI: 10.1038/srep17754
MYB94 and MYB96 Additively Activate Cuticular Wax Biosynthesis in Arabidopsis.2016 · DOI: 10.1093/pcp/pcw147
MYB96 recruits the HDA15 protein to suppress negative regulators of ABA signaling in Arabidopsis.2019 · DOI: 10.1038/s41467-019-09417-1

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_006284 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0001666 response to hypoxia 生物过程
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0009644 response to high light intensity 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009733 response to auxin 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G28910
ath:AT3G47600
ath:AT5G62470
vvi:100233072
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.886
排名 1 · TkA03G025710 · TK1151
细胞质0.240
排名 2 · TkA03G025710 · TK1151
线粒体0.026
排名 3 · TkA03G025710 · TK1151
细胞膜0.021
排名 4 · TkA03G025710 · TK1151
内质网0.010
排名 5 · TkA03G025710 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00249Myb_DNA-binding14-61 aa
PF13921Myb_DNA-bind_617-77 aa
PF23588HTH_CHD1_Hrp317-46 aa
PF00249Myb_DNA-binding67-112 aa
PF13921Myb_DNA-bind_670-118 aa
PF15963Myb_DNA-bind_773-135 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G025710PF00249Myb_DNA-binding14615e-35120.1
TkA03G025710PF13921Myb_DNA-bind_617772.4e-2176.4
TkA03G025710PF23588HTH_CHD1_Hrp317460.004517.7
TkA03G025710PF00249Myb_DNA-binding671125e-35120.1
TkA03G025710PF13921Myb_DNA-bind_6701182.4e-2176.4
TkA03G025710PF15963Myb_DNA-bind_7731350.02814.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SCU7拟南芥sp|Q9SCU7|MYB30_ARATH Transcription factor MYB3052.100%Swiss-Prot高置信
Q9SN78拟南芥sp|Q9SN78|MYB94_ARATH Transcription factor MYB9463.300%Swiss-Prot中等置信
Q24JK1拟南芥sp|Q24JK1|MYB96_ARATH Transcription factor MYB9649.000%Swiss-Prot中等置信

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