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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G616520
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 158935167-158941365 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2966 bp · TkA02G616520|TK1151|cDNA

CAAACACAGTCGTCAATTATCGCTCTCGCTCTTGATATGGGTGTGTAAAACCATGGAGGGAACAGAAGAAAACTAGACCACACAAATTTCAGTTCACCTTCTGCTACGGATCCAAATCCGAGAAGTTTCCTTTGCTCTGATGTTGGCTAAAAGATTCCCTATTTGATTTTACAAGCACCGACATATGTATTCATGCGAGACTACTACGATGTTGTTAGGTCGCGGAAGCTCTTTAATCCTTGTCAGAAACTCCAATTGCC...

CDS

下载 CDS FASTA

1248 bp · TkA02G616520|TK1151|CDS

ATGGAAGTAACCTTATCTAGTCGCCTTAAAAGTTTGTACAGCATCTATAGTAAGATGAATCGTAAAGATGTGAGCATTGATAACGTATATGATGCACGTGCACTGAGAGTAGTTGTTGGAGATAAAAGTGGAACTTTACACGGACAAGCTGTTGAGTGTTGTTACAATCTTCTAAATATCATACACAGGCTTTGGACACCAATTGATGGCGAATTTGATGATTACATTGTCAATCCAAAGCCAAGTGGATATCAGTCTCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

415 aa · TkA02G616520|TK1151|PROTEIN

MEVTLSSRLKSLYSIYSKMNRKDVSIDNVYDARALRVVVGDKSGTLHGQAVECCYNLLNIIHRLWTPIDGEFDDYIVNPKPSGYQSLHTAVHGPEKSSLEVQIRTQSMHEYAEHGVAAHWLYKEAGNKLPTKSSVIDSKRTSASYLMEDKSPVDVLHKYRSLKPGHPVLRVEGSHLLAAVIVRVDEDGRDLLVAASFVLAASEAVADRRPSSQRKRWEAYARLYKKVSDEWWCEAGHGDWCTCLEKYTLCRDGMYHKQDQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G616520
TK1151 IDTkA02G616520
OH-1004 IDLXL04_011776
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 48.425
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G616520
位置Chr02:158935167-158941365 (+)
描述Similar to spoT: Probable guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase (Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa)
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011776 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0010150 leaf senescence 生物过程
GO:0015949 nucleobase-containing small molecule interconversion 生物过程
GO:0015969 guanosine tetraphosphate metabolic process 生物过程
GO:0015970 guanosine tetraphosphate biosynthetic process 生物过程
GO:0015979 photosynthesis 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0005525 GTP binding 分子功能
GO:0008728 GTP diphosphokinase activity 分子功能
GO:0008893 guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-diphosphatase activity 分子功能
GO:0016301 kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G54130
bbu:BB_0198
dosa:Os08g0457600
syn:slr1325
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.450
排名 1 · TkA02G616520 · TK1151
细胞质0.242
排名 2 · TkA02G616520 · TK1151
细胞核0.183
排名 3 · TkA02G616520 · TK1151
线粒体0.148
排名 4 · TkA02G616520 · TK1151
细胞膜0.058
排名 5 · TkA02G616520 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04607RelA_SpoT7-126 aa
PF06286Coleoptericin150-191 aa
PF24500DUF7589157-292 aa
PF02824TGS360-412 aa
PF02597ThiS370-412 aa
PF01479S4387-410 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G616520PF04607RelA_SpoT71266.8e-37126.9
TkA02G616520PF06286Coleoptericin1501910.1213.2
TkA02G616520PF24500DUF75891572921.5e-73246.2
TkA02G616520PF02824TGS3604123.7e-0730.8
TkA02G616520PF02597ThiS3704120.02815.7
TkA02G616520PF01479S43874100.0414.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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