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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G593980
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 153231319-153237338 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

735 bp · TkA02G593980|TK1151|cDNA

GAGACTTTTGTTAGGACTTTTCTCTGATACTAGAAACGTCGATCGATCAGTCGAATCAAGGCGAAAGAACATTTGTGTGAAAATGGCGAACATGCTTCGATGCCAGAGGATCGGCTGTAACGCTACTTTCACGGATGATGATAATCCCGAGGGCTCTTGCACATATCATGAGTCGATGCAAGACAGGCAAACACACAACAGAAAAACCAGTGATAGCAAAAAAGGCTTCTACCCCTGCCCCAAAGCAAGTTATCAAAACA...

CDS

下载 CDS FASTA

684 bp · TkA02G593980|TK1151|CDS

ATGGATTATGTCTCTGAATCAGTTCCTTTAGACTTTAGTTATACATTGTCTAACATGTTTGTTTTTTGTGCATTGGCTTTGTTAATCAACCGGGAACTCTCATTAATCCAGGGACCTCTATTTCACGACGGTATGAAAGAGTGGAGCTGTTGCAAAAAAAGAAGTCATGATTTCACCTTATTCTTAGAAATCCCAGGATGCAAGACAGGCAAACACACAACAGAAAAACCAGTGATAGCAAAAAAGGCTTCTACCCCTGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

227 aa · TkA02G593980|TK1151|PROTEIN

MDYVSESVPLDFSYTLSNMFVFCALALLINRELSLIQGPLFHDGMKEWSCCKKRSHDFTLFLEIPGCKTGKHTTEKPVIAKKASTPAPKQVIKTPTTNPITKESCPRCRQGFFCSDHGSQVKDMKPKPSYEAESTSEESVKVKVKASPVVKKVVDINEPQICKNKGCGQTFKEIDNHETACNYHPGPAVFHDRLRGWKCCDIHVKEFDEFMGIPPCAKGWHDAEAAS

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G593980
TK1151 IDTkA02G593980
OH-1004 IDLXL04_012001
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 83.700 / OH-1004 86.364
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G593980
位置Chr02:153231319-153237338 (-)
描述Similar to RAR1: Cysteine and histidine-rich domain-containing protein RAR1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g51700 植物先天免疫专用。
Regulatory role of SGT1 in early R gene-mediated plant defenses.2002 · DOI: 10.1126/science.1067747
Arabidopsis RAR1 exerts rate-limiting control of R gene-mediated defenses against multiple pathogens.2002 · DOI: 10.1105/tpc.001040
RAR1 and NDR1 contribute quantitatively to disease resistance in Arabidopsis, and their relative contributions are dependent on the R gene assayed.2002 · DOI: 10.1105/tpc.001032
Cytosolic HSP90 associates with and modulates the Arabidopsis RPM1 disease resistance protein.2003 · DOI: 10.1093/emboj/cdg547
Antagonistic control of disease resistance protein stability in the plant immune system.2005 · DOI: 10.1126/science.1109977
Enhanced defense responses in Arabidopsis induced by the cell wall protein fractions from Pythium oligandrum require SGT1, RAR1, NPR1 and JAR1.2009 · DOI: 10.1093/pcp/pcp044
Specific Arabidopsis HSP90.2 alleles recapitulate RAR1 cochaperone function in plant NB-LRR disease resistance protein regulation.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0904877106

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0535400 参与对白叶枯病 强毒株和稻瘟病菌 亲和种的基础抗病性。
RAR1 and HSP90 form a complex with Rac/Rop GTPase and function in innate-immune responses in rice.2007 · DOI: 10.1105/tpc.107.055517
OsRAR1 and OsSGT1 physically interact and function in rice basal disease resistance.2008 · DOI: 10.1094/mpmi-21-3-0294
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012001 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002679 respiratory burst involved in defense response 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0010824 regulation of centrosome duplication 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0050821 protein stabilization 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0008270 zinc ion binding 分子功能
GO:0031267 small GTPase binding 分子功能
GO:0046872 metal ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G51700
xla:414542
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.549
排名 1 · TkA02G593980 · TK1151
细胞核0.433
排名 2 · TkA02G593980 · TK1151
线粒体0.088
排名 3 · TkA02G593980 · TK1151
内质网0.075
排名 4 · TkA02G593980 · TK1151
细胞膜0.070
排名 5 · TkA02G593980 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04968CHORD38-72 aa
PF26782DUF825448-80 aa
PF04968CHORD161-221 aa
PF26782DUF8254166-186 aa
PF26782DUF8254197-222 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G593980PF04968CHORD38728e-39132.8
TkA02G593980PF26782DUF825448804.38.5
TkA02G593980PF04968CHORD1612218e-39132.8
TkA02G593980PF26782DUF82541661864.38.5
TkA02G593980PF26782DUF82541972224.38.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SE33拟南芥sp|Q9SE33|RAR1_ARATH Cysteine and histidine-rich domain-containing protein RAR170.000%Swiss-Prot高置信
Q6EPW7水稻sp|Q6EPW7|RAR1_ORYSJ Cysteine and histidine-rich domain-containing protein RAR164.700%Swiss-Prot高置信

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