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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G361000
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 91790403-91800429 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2279 bp · TkA02G361000|TK1151|cDNA

TGTATATGTATATATAGTCCTCTGTTGTTCTCCAAGAAGAACAACAAACTTTTCTTCCAGAAAATGGGAACCCAAAAGGAAACTATGCTTGAAGAAATGAAAACACGTTTAGATGAGAAAAAGGTTTTTTCTTCTGGGAAAGAGAGAGCTCCATTGTTTGGTTGGCCATGGCAGAATCTGTCAAACTTCAAGTACTTGTTGTACGGGCCACTTCTTGCTGAGTTCATATATTCAAGAATCTATGGAAAGAAGCACAGTGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1251 bp · TkA02G361000|TK1151|CDS

ATGGGAACCCAAAAGGAAACTATGCTTGAAGAAATGAAAACACGTTTAGATGAGAAAAAGGTTTTTTCTTCTGGGAAAGAGAGAGCTCCATTGTTTGGTTGGCCATGGCAGAATCTGTCAAACTTCAAGTACTTGTTGTACGGGCCACTTCTTGCTGAGTTCATATATTCAAGAATCTATGGAAAGAAGCACAGTGAGTATAGTTGGTGTTTGCATATTCTAATATTGTCTTCACTAAGAGGACTTGTGCACCAGCTATG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

416 aa · TkA02G361000|TK1151|PROTEIN

MGTQKETMLEEMKTRLDEKKVFSSGKERAPLFGWPWQNLSNFKYLLYGPLLAEFIYSRIYGKKHSEYSWCLHILILSSLRGLVHQLWSSYNNMLFLNRNHRLSEKGIDFDQIDKEWHWDNFILLEAFVASIILLINPSISNLPIWKTSGITACIIFHVGLSEPLYYWLHRLLLHSPSFFQQYHWLHHSSQVNHPFTAGHATLLEHLLLCVIMGVPLVGTALIGQGSVILFYGYVLIFDFLRCMGHSNIEVVPHHIFHTMP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G361000
TK1151 IDTkA02G361000
OH-1004 IDLXL04_031990
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 84.856 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G361000
位置Chr02:91790403-91800429 (+)
描述暂无功能描述
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g57800 参与角质膜和蜡的产生，以及花粉的伤寒和孢粉质生物合成。
Cloning and characterization of the WAX2 gene of Arabidopsis involved in cuticle membrane and wax production.2003 · DOI: 10.1105/tpc.010926
A novel male-sterile mutant of Arabidopsis thaliana, faceless pollen-1, produces pollen with a smooth surface and an acetolysis-sensitive exine.2003 · DOI: 10.1023/b:plan.0000009269.97773.70

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2Z1F5 醛脱羰酶参与醛向烷烃的转化。 暂无已核实直接文献
Os09g0426800 醛脱羰酶参与醛向烷烃的转化。 暂无已核实直接文献
Os06g0653000 醛脱羰酶参与醛向烷烃的转化。 暂无已核实直接文献
Os02g0178800 醛脱羰酶参与醛向烷烃的转化。
Characterization of Glossy1-homologous genes in rice involved in leaf wax accumulation and drought resistance.2009 · DOI: 10.1007/s11103-009-9483-0
UniProt: B8AIW3 醛脱羰酶参与醛向烷烃的转化。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031990 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0008610 lipid biosynthetic process 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0010025 wax biosynthetic process 生物过程
GO:0010143 cutin biosynthetic process 生物过程
GO:0043447 alkane biosynthetic process 生物过程
GO:0046184 aldehyde biosynthetic process 生物过程
GO:0048235 pollen sperm cell differentiation 生物过程
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G57800
dosa:Os02g0178800
dosa:Os09g0426800
osa:4328496
osa:4347115
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.842
排名 1 · TkA02G361000 · TK1151
细胞核0.094
排名 2 · TkA02G361000 · TK1151
高尔基体0.068
排名 3 · TkA02G361000 · TK1151
细胞质0.063
排名 4 · TkA02G361000 · TK1151
细胞膜0.042
排名 5 · TkA02G361000 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04116FA_hydroxylase65-75 aa
PF04116FA_hydroxylase156-296 aa
PF21745PMI1_PMIR1-2_C236-261 aa
PF21745PMI1_PMIR1-2_C279-315 aa
PF04116FA_hydroxylase344-390 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G361000PF04116FA_hydroxylase65752.4e-1661.1
TkA02G361000PF04116FA_hydroxylase1562962.4e-1661.1
TkA02G361000PF21745PMI1_PMIR1-2_C2362610.05514.7
TkA02G361000PF21745PMI1_PMIR1-2_C2793150.05514.7
TkA02G361000PF04116FA_hydroxylase3443902.4e-1661.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8H1Z0拟南芥sp|Q8H1Z0|CER3_ARATH Very-long-chain aldehyde decarbonylase CER355.500%Swiss-Prot高置信
A2Z1F5水稻sp|A2Z1F5|GLO11_ORYSI Very-long-chain aldehyde decarbonylase GL1-149.100%Swiss-Prot中等置信
Q69PA8水稻sp|Q69PA8|GLO11_ORYSJ Very-long-chain aldehyde decarbonylase GL1-149.100%Swiss-Prot中等置信
Q67WQ7水稻sp|Q67WQ7|GLO13_ORYSJ Very-long-chain aldehyde decarbonylase GL1-347.400%Swiss-Prot中等置信
Q6ETL8水稻sp|Q6ETL8|GLO12_ORYSJ Very-long-chain aldehyde decarbonylase GL1-248.100%Swiss-Prot中等置信
B8AIW3水稻sp|B8AIW3|GLO12_ORYSI Very-long-chain aldehyde decarbonylase GL1-272.700%Swiss-Prot高置信

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