TkA02G074720 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G074720

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 19373047-19374737 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

937 bp · TkA02G074720|TK1151|cDNA

CGGATCTAAATTATCTAATCAGACAATTCACTTTTATCGACATGGTGAATATTTAAACTTGTAAAAAGTATCTAATTACAAATCGTATATGAAATCGTATAAATACAAGTCAATCCGCAAACCAGGAATCCCTAAATCAAATTTCTAAAAAACCTTCCCACAATCCCAACTTCCCATTCAGTTAATCAAGAGCTATTGGTATAGATTTTTCTCGGAGCCCCAATTTTCTCATAGGTACAAATTCTGACGTAAACAAACAG...

CDS

下载 CDS FASTA

603 bp · TkA02G074720|TK1151|CDS

ATGGGCCAAGATCAAAGCAAGCCCACTGATTCCCCCGTACCTATTCCAAAAAGGTCGGAATCGGAATCAGAACCAAAACCGGAATCGGAATCATCTACTCCCCCATCAATGGAATCCTTACTGGCAGAAGCCACGGCATATGGAAACAAAGATGAAGATTTATCAATGGAAGAGAAAGCTCAAAAAGCCCTAGAATGCCCTTGTATCCAAAACCTTAGGAGTGGGCCATGTGGGTCCCAGTTTTCGGATGCCTTTCTATG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

200 aa · TkA02G074720|TK1151|PROTEIN

MGQDQSKPTDSPVPIPKRSESESEPKPESESSTPPSMESLLAEATAYGNKDEDLSMEEKAQKALECPCIQNLRSGPCGSQFSDAFLCFLMSTAEEKGSECVIPFVALQRCIQTNPNAFPKDVLENDDVAKEEKKKPVEDYKIFLRGGQWNRQIQNISFRIGKGNGMELLIPLDEFHNIMSRLYVTCYYYCLIVHIVTNIK

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G074720`
TK1151 ID	TkA02G074720
OH-1004 ID	LXL04_017106
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)	98.600
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 71.500 / OH-1004 86.145 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G074720

位置 Chr02:19373047-19374737 (+)

描述 Similar to MIA40: Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40 homolog

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g23395`	参与线粒体膜间隙中小型含半胱氨酸蛋白的导入和折叠（可能）。	Conserved and novel functions for Arabidopsis thaliana MIA40 in assembly of proteins in mitochondria and peroxisomes.2010 · DOI: 10.1074/jbc.m110.121202

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os04g0527700`	参与线粒体膜间隙中小型半胱氨酸含量蛋白的进口和折叠所必需。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017106 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006625 protein targeting to peroxisome 生物过程

GO:0006626 protein targeting to mitochondrion 生物过程

GO:0033108 mitochondrial respiratory chain complex assembly 生物过程

GO:0034599 cellular response to oxidative stress 生物过程

GO:0043504 mitochondrial DNA repair 生物过程

GO:0045041 protein import into mitochondrial intermembrane space 生物过程

GO:0046825 regulation of protein export from nucleus 生物过程

GO:0051604 protein maturation 生物过程

GO:0072655 establishment of protein localization to mitochondrion 生物过程

GO:0160203 mitochondrial disulfide relay system 生物过程

GO:1901857 positive regulation of cellular respiration 生物过程

GO:1990830 cellular response to leukemia inhibitory factor 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT5G23395

dosa:Os04g0527700

hsa:131474

mmu:72170

rno:312559

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.579

排名 1 · TkA02G074720 · TK1151

细胞质0.184

排名 2 · TkA02G074720 · TK1151

质体0.130

排名 3 · TkA02G074720 · TK1151

细胞核0.109

排名 4 · TkA02G074720 · TK1151

过氧化物酶体0.109

排名 5 · TkA02G074720 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF06747CHCH77-112 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G074720	`PF06747`	CHCH	77	112	0.01	16.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q8GYJ4`	拟南芥	sp\|Q8GYJ4\|MIA40_ARATH Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40 homolog	63.100%	Swiss-Prot	中等置信
`Q7XKI7`	水稻	sp\|Q7XKI7\|MIA40_ORYSJ Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40 homolog	50.400%	Swiss-Prot	中等置信

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