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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA01G630780
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 159506825-159508719 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

1586 bp · TkA01G630780|TK1151|cDNA

ATCACTTGTTGTTCTAAGATTTGATTATTTCCTTGGAATAAATGTTGTGTCATGGAAGAAAATGGTGAACATATGTTGCTGCTGCTTCTGCTGCATGGAAGAAGAAACTAAATCCATCTTACCAGCCTCATGATTCTTCTTCCTTCTCAAGCTTTTGAATTTGTGGTTAGGACTCGCGGTTTTCGGTTGTTCAGAGGAAAAGGGATCGATTTTTCTGTTTCGGAATTTGAAATTTATATCTTCGAAGAAATTGATTAGTG...

1029 bp · TkA01G630780|TK1151|CDS

ATGGGGACTCGAACCATGGGATCGCATGGCGCTGGTGGTGGAAATGGTGGAATCCAACATCCTAAATCCGATGGATTGTCAAAACAAGGCGCTCTGTATAACCTAACATTGGACGAGGTTCAACATCAATTAGGCGATTTAGGGAAACCTTTAAGTAGCATGAATCTCGACGAGCTTCTAAAAAACGTCTGGACTGCCGAAGGTGAATCTAATCAAGCACCTGGACCACTTGATCTCCATCACCACACACAACTTGCTTC...

342 aa · TkA01G630780|TK1151|PROTEIN

MGTRTMGSHGAGGGNGGIQHPKSDGLSKQGALYNLTLDEVQHQLGDLGKPLSSMNLDELLKNVWTAEGESNQAPGPLDLHHHTQLASTSSMARQSSLADLSKKTVDELWQDIQKKKDTTTTLTSSGIDNNGGSGGGYNLERKSTQEKQQTLGEMTLEDFLAKAGIVAEEKKKKNSGSVIVPESIQNIVPQQAQWMQYQTPAIPQQQQQQQQQQQQHVFMTGHHQAQQSLPMEAAYPDTHMTVSPLMGTLSDTQTPGRKRV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G630780
TK1151 IDTkA01G630780
OH-1004 IDLXL04_000157
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)99.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.491 / OH-1004 71.868
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G630780
位置Chr01:159506825-159508719 (-)
描述Similar to DPBF3: ABSCISIC ACID-INSENSITIVE 5-like protein 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g56850 结合到胚胎特异性元件和 Dc3 基因启动子的 ABA 响应元件 (ABRE)。 暂无已核实直接文献
At2g41070 结合胚胎特异元件和Dc3基因启动子的ABA响应元件(ABRE),以及Em1基因启动子的ABRE。 暂无已核实直接文献
At2g36270 作为 ABA 生长抑制的主要介质,参与种子发育和随后的营养阶段 ABA 调节的基因表达。
At1g49720 结合ABA响应元素(ABRE)。 暂无已核实直接文献

水稻

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_000157 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009739 response to gibberellin 生物过程
GO:0009789 positive regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009845 seed germination 生物过程
GO:0010115 regulation of abscisic acid biosynthetic process 生物过程
GO:0010152 pollen maturation 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G36270
ath:AT2G41070
ath:AT3G56850
dosa:Os01g0859300
dosa:Os06g0211200
osa:4325061
osa:4340462
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞核0.953
排名 1 · TkA01G630780 · TK1151
细胞质0.141
排名 2 · TkA01G630780 · TK1151
细胞膜0.028
排名 3 · TkA01G630780 · TK1151
内质网0.013
排名 4 · TkA01G630780 · TK1151
线粒体0.009
排名 5 · TkA01G630780 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03131bZIP_Maf31-49 aa
PF03131bZIP_Maf51-62 aa
PF03153TFIIA86-287 aa
PF28727DUF845188-121 aa
PF03131bZIP_Maf99-114 aa
PF00170bZIP_1102-117 aa
PF28727DUF8451143-174 aa
PF03131bZIP_Maf201-215 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G630780PF03131bZIP_Maf31490.005118.0
TkA01G630780PF03131bZIP_Maf51620.005118.0
TkA01G630780PF03153TFIIA862870.0315.0
TkA01G630780PF28727DUF8451881210.212.3
TkA01G630780PF03131bZIP_Maf991140.005118.0
TkA01G630780PF00170bZIP_11021171.6e-1248.1
TkA01G630780PF28727DUF84511431740.212.3
TkA01G630780PF03131bZIP_Maf2012150.005118.0
TkA01G630780PF07716bZIP_22092114.7e-1040.1
TkA01G630780PF07716bZIP_22693184.7e-1040.1
TkA01G630780PF00170bZIP_12723171.6e-1248.1
TkA01G630780PF03131bZIP_Maf2723180.005118.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LES3拟南芥sp|Q9LES3|AI5L2_ARATH ABSCISIC ACID-INSENSITIVE 5-like protein 249.300%Swiss-Prot中等置信
Q9C5Q2拟南芥sp|Q9C5Q2|AI5L3_ARATH ABSCISIC ACID-INSENSITIVE 5-like protein 346.600%Swiss-Prot中等置信
Q9SJN0拟南芥sp|Q9SJN0|ABI5_ARATH Protein ABSCISIC ACID-INSENSITIVE 536.800%Swiss-Prot中等置信
Q9M7Q5拟南芥sp|Q9M7Q5|AI5L4_ARATH ABSCISIC ACID-INSENSITIVE 5-like protein 432.000%Swiss-Prot中等置信
Q69TW5水稻sp|Q69TW5|BZP46_ORYSJ bZIP transcription factor 4635.900%Swiss-Prot中等置信

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