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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G613880
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 154778777-154782251 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3252 bp · TkA01G613880|TK1151|cDNA

GTTTCCCAACAATATATAAATGAGCTGAATTTGTTTCATTCCATGATATCAACTTTTGTGATGAGCCCTATAAAGTATACAAATGAACTGAATCTGCTTGATTCCATGATATCAAGGGGCTGTAGTAGAATTCAGTCGTAACATGAAGGGCTTAGATGAAACTAACCTTAGTAAATTGGTTGCCCTCTGCATAAGGTATTGCGTAACAAAAGAGACAAACAAACGCTCTGACACACACCCCGACCCTTCAACAACGCACG...

CDS

下载 CDS FASTA

2337 bp · TkA01G613880|TK1151|CDS

ATGATGAACATGAACAGACCTCCGAATGAAGATTTCTCGCTCAAAGAGACGAAACCTCACCTCGGTGGAGGAAAAGTCACCGGAGATAAGCTCACAAGCACCTACGACCTCGTCGAACAAATGCAGTACTTATACGTTCGTGTCGTTAAAGCCAAAGATTTACCCACAAAGGACGTCACCGGCAGCTGCGACCCCTACGTCGAGGTCCGAATGGGGAACTACAAAGGAACAACTCGTCATTTCGAGAAGAAAACAAATCC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

778 aa · TkA01G613880|TK1151|PROTEIN

MMNMNRPPNEDFSLKETKPHLGGGKVTGDKLTSTYDLVEQMQYLYVRVVKAKDLPTKDVTGSCDPYVEVRMGNYKGTTRHFEKKTNPEWNQVFSFSKDRIQATMLEVTVKDKDLMKDDIMGGVLFDLNEVPKRVPPDSPLAPQWYRLSDRKGDKLKGELMLAVWWGTQADEAFPEAWHSDAAAVSADGLASIRSKVYLSPKLWYLRVNVIEAQDLIPNDRTRFPEVYVKAILGNQALRTRISTSKTINPLWNEDLMFVAA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G613880
TK1151 IDTkA01G613880
OH-1004 IDLXL04_000405
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 94.647
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G613880
位置Chr01:154778777-154782251 (+)
描述Similar to FTIP3: FT-interacting protein 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g57880 在顶端分生组织 (SAM) 中的芽干细胞增殖和分化中必需，从而通过控制 STM 在芽顶的亚细胞定位和细胞间运输，决定芽干细胞的维持与其分化为其他地上植物部分之间的适当平衡。
FTIP-Dependent STM Trafficking Regulates Shoot Meristem Development in Arabidopsis.2018 · DOI: 10.1016/j.celrep.2018.04.033
At1g51570 在顶端分生组织 (SAM) 中的芽干细胞增殖和分化中必需，从而通过控制 STM 在芽顶的亚细胞定位和细胞间运输，决定芽干细胞的维持与其分化为其他地上植物部分之间的适当平衡。
FTIP-Dependent STM Trafficking Regulates Shoot Meristem Development in Arabidopsis.2018 · DOI: 10.1016/j.celrep.2018.04.033
At5g12970 可能通过调节其他调控因子的运输发挥信号分子的功能。 暂无已核实直接文献
At4g11610 可能通过调节其他调控因子的运输发挥信号分子的功能。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0370600 促进转录因子 OSH1 的核转位，在花药发育后期直接抑制生长素生物合成基因 YUCCA4。
OsFTIP7 determines auxin-mediated anther dehiscence in rice.2018 · DOI: 10.1038/s41477-018-0175-0
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000405 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009663 plasmodesma organization 生物过程
GO:0009901 anther dehiscence 生物过程
GO:0009908 flower development 生物过程
GO:0009911 positive regulation of flower development 生物过程
GO:0010228 vegetative to reproductive phase transition of meristem 生物过程
GO:0010930 negative regulation of auxin mediated signaling pathway 生物过程
GO:0048574 long-day photoperiodism, flowering 生物过程
GO:0048578 positive regulation of long-day photoperiodism, flowering 生物过程
GO:1902182 shoot apical meristem development 生物过程
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G51570
ath:AT3G57880
ath:AT5G06850
ath:AT5G12970
dosa:Os05g0370600
osa:4338582
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.390
排名 1 · TkA01G613880 · TK1151
细胞膜0.349
排名 2 · TkA01G613880 · TK1151
细胞质0.250
排名 3 · TkA01G613880 · TK1151
高尔基体0.188
排名 4 · TkA01G613880 · TK1151
细胞核0.085
排名 5 · TkA01G613880 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00168C243-146 aa
PF00168C2203-309 aa
PF00168C2365-478 aa
PF06398Pex24p513-567 aa
PF08372PRT_C577-616 aa
PF11696DUF3292579-633 aa
PF04842DUF639586-626 aa
PF02453Reticulon595-635 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G613880PF00168C2431462.7e-69230.7
TkA01G613880PF00168C22033092.7e-69230.7
TkA01G613880PF00168C23654782.7e-69230.7
TkA01G613880PF06398Pex24p5135676.3e-0729.5
TkA01G613880PF08372PRT_C5776161.6e-83278.9
TkA01G613880PF11696DUF32925796330.569.3
TkA01G613880PF04842DUF6395866260.1612.1
TkA01G613880PF02453Reticulon5956350.4411.2
TkA01G613880PF06398Pex24p5967596.3e-0729.5
TkA01G613880PF05545FixQ6116170.1612.7
TkA01G613880PF08372PRT_C6237781.6e-83278.9
TkA01G613880PF05545FixQ6256470.1612.7
TkA01G613880PF11696DUF32926847450.569.3
TkA01G613880PF04842DUF6397057440.1612.1
TkA01G613880PF02453Reticulon7087450.4411.2
TkA01G613880PF05545FixQ7217340.1612.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9M2R0拟南芥sp|Q9M2R0|FTIP3_ARATH FT-interacting protein 386.600%Swiss-Prot高置信
Q9C8H3拟南芥sp|Q9C8H3|FTIP4_ARATH FT-interacting protein 484.400%Swiss-Prot高置信
Q9LXU2拟南芥sp|Q9LXU2|MCTP5_ARATH Multiple C2 domain and transmembrane region protein 579.900%Swiss-Prot高置信
Q84TJ7拟南芥sp|Q84TJ7|MCTP7_ARATH Multiple C2 domain and transmembrane region protein 768.000%Swiss-Prot高置信
Q60EW9水稻sp|Q60EW9|FTIP7_ORYSJ FT-interacting protein 782.200%Swiss-Prot高置信

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