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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G607840
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 153179427-153180824 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1350 bp · TkA01G607840|TK1151|cDNA

ATGGTGTTTTTCATCACCATTTTGTCTTTCCTTCCTTTCGTATACCTTCTCTACATTCTCCTCAGTTATCTTGACCGAAAAAAGCATCAGAAATGTTACTTACTGGATTACCAGTTGTACAAACCCTCCGACGAGCGGAAACTGCCGACAGAATTATCCGGTGACATCATAAAACGGGCCAAGAGTCTTGGTTTAAACGAGTACAAGTTTCTTCTAAAAGCGATAGTCAGCTCCGGTATTGGTGAAGAAACCTACGCTCC...

CDS

下载 CDS FASTA

1350 bp · TkA01G607840|TK1151|CDS

ATGGTGTTTTTCATCACCATTTTGTCTTTCCTTCCTTTCGTATACCTTCTCTACATTCTCCTCAGTTATCTTGACCGAAAAAAGCATCAGAAATGTTACTTACTGGATTACCAGTTGTACAAACCCTCCGACGAGCGGAAACTGCCGACAGAATTATCCGGTGACATCATAAAACGGGCCAAGAGTCTTGGTTTAAACGAGTACAAGTTTCTTCTAAAAGCGATAGTCAGCTCCGGTATTGGTGAAGAAACCTACGCTCC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

449 aa · TkA01G607840|TK1151|PROTEIN

MVFFITILSFLPFVYLLYILLSYLDRKKHQKCYLLDYQLYKPSDERKLPTELSGDIIKRAKSLGLNEYKFLLKAIVSSGIGEETYAPKMMFEGREENPTHQDAIEEMEELFEDTIGKLLRRTGISASEIDVLVVNISMFACMPSLSSRIVNRYKMRDDIKTYNLCGMGCSASLISLNIVESVFKTKKNQLAMVVTSESLTPNWYTGNDKSMILSNCLFRSGGCAMILTNKPSLAHKSMMKLNCLVRTHHGAKDESYGCCV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G607840
TK1151 IDTkA01G607840
OH-1004 IDLXL04_000503
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)96.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G607840
位置Chr01:153179427-153180824 (-)
描述Similar to KCS12: 3-ketoacyl-CoA synthase 12
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g28630 3-酮酰辅酶A合酶12。 暂无已核实直接文献
At1g07720 3-酮酰辅酶A合酶3。 暂无已核实直接文献
At5g04530 3-酮酰辅酶A合酶 19。 暂无已核实直接文献
At1g01120 有助于角质层蜡和木栓质的生物合成。
KCS1 encodes a fatty acid elongase 3-ketoacyl-CoA synthase affecting wax biosynthesis in Arabidopsis thaliana.1999 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.1999.00352.x
Specific and differential inhibition of very-long-chain fatty acid elongases from Arabidopsis thaliana by different herbicides.2004 · DOI: 10.1073/pnas.0404600101
Substrate specificity of Arabidopsis 3-ketoacyl-CoA synthases.2006 · DOI: 10.1016/j.bbrc.2006.05.162
At2g46720 参与角质层蜡和木栓质的生物合成（基于相似性推测）。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000503 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000038 very long-chain fatty acid metabolic process 生物过程
GO:0006633 fatty acid biosynthetic process 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0010025 wax biosynthetic process 生物过程
GO:0030497 fatty acid elongation 生物过程
GO:0042761 very long-chain fatty acid biosynthetic process 生物过程
GO:0070417 cellular response to cold 生物过程
GO:0160062 cutin-based cuticle development 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G01120
ath:AT1G07720
ath:AT2G28630
ath:AT2G46720
ath:AT5G04530
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.853
排名 1 · TkA01G607840 · TK1151
细胞膜0.074
排名 2 · TkA01G607840 · TK1151
细胞质0.068
排名 3 · TkA01G607840 · TK1151
线粒体0.050
排名 4 · TkA01G607840 · TK1151
细胞核0.044
排名 5 · TkA01G607840 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08392FAE1_CUT1_RppA26-310 aa
PF03645Tctex-138-77 aa
PF24012DUF732696-121 aa
PF02797Chal_sti_synt_C102-125 aa
PF00195Chal_sti_synt_N103-231 aa
PF08541ACP_syn_III_C119-135 aa
PF08545ACP_syn_III167-230 aa
PF08541ACP_syn_III_C316-401 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G607840PF08392FAE1_CUT1_RppA263105.5e-114381.1
TkA01G607840PF03645Tctex-138770.212.7
TkA01G607840PF24012DUF7326961210.2212.6
TkA01G607840PF02797Chal_sti_synt_C1021258.7e-0936.3
TkA01G607840PF00195Chal_sti_synt_N1032310.02614.7
TkA01G607840PF08541ACP_syn_III_C1191357.6e-1658.8
TkA01G607840PF08545ACP_syn_III1672300.01316.1
TkA01G607840PF08541ACP_syn_III_C3164017.6e-1658.8
TkA01G607840PF02797Chal_sti_synt_C3233968.7e-0936.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SIB2拟南芥sp|Q9SIB2|KCS12_ARATH 3-ketoacyl-CoA synthase 1264.000%Swiss-Prot高置信
Q9LQP8拟南芥sp|Q9LQP8|KCS3_ARATH 3-ketoacyl-CoA synthase 364.700%Swiss-Prot高置信
Q9LZ72拟南芥sp|Q9LZ72|KCS19_ARATH 3-ketoacyl-CoA synthase 1950.100%Swiss-Prot高置信
Q9MAM3拟南芥sp|Q9MAM3|KCS1_ARATH 3-ketoacyl-CoA synthase 141.400%Swiss-Prot中等置信
Q9ZUZ0拟南芥sp|Q9ZUZ0|KCS13_ARATH 3-ketoacyl-CoA synthase 1340.800%Swiss-Prot中等置信

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